About: PyMOL

An Entity of Type: software, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

PyMOL is an open source but proprietary molecular visualization system created by Warren Lyford DeLano. It was commercialized initially by DeLano Scientific LLC, which was a private software company dedicated to creating useful tools that become universally accessible to scientific and educational communities. It is currently commercialized by Schrödinger, Inc. As the original software license was a permissive licence, they were able to remove it; new versions are no longer released under the Python license, but under a custom license (granting broad use, redistribution, and modification rights, but assigning copyright to any version to Schrodinger, LLC.), and some of the source code is no longer released. PyMOL can produce high-quality 3D images of small molecules and biological macromole

Property Value
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  • PyMOL és un visor molecular de codi obert creat per i comercialitzat per , una companyia dedicada a la creació d'eines accessibles universalment per a les comunitats científiques i educatives. PyMOL és apropiat per a reproduir imatges 3D d'alta qualitat de molècules petites i de macromolècules biològiques, com les proteïnes. PyMOL és una de les poques eines de visualització de font oberta disponibles per a la biologia estructural. La part Py del seu nom al·ludeix al fet que és creat mitjançant el llenguatge de programació Python, en ser extensible això permet que es puguin realitzar anàlisis complexes d'estructures moleculars utilitzant biblioteques disponibles par Python com NumPy o . (ca)
  • PyMOL je neziskový multiplatformní software s open source licencí sponzorovaný samotnými uživateli. Své využití nachází v biochemických oborech zabývajících se strukturou biopolymerů (DNA, RNA, proteiny), jejich vzájemnými interakcemi apod. PyMOL slouží ke grafickému zobrazování, sdílení a analýze molekulárních dat získaných nejčastěji měřením buď metodou NMR spektroskopie, nebo X-ray krystalografie. Pro práci s těmito daty je využíván formát souboru .pdb. Jednou z nejpoužívanějších databází molekulárních dat je databáze Protein data bank (odtud zkratka PDB a formát .pdb), která k roku 2017 obsahuje přes 136 000 struktur. PyMOL je celosvětově používaný software. Neexistuje však žádná česká verze programu a čeští uživatelé se musí spokojit s anglickou verzí. První část názvu softwaru - Py značí, že je software napsán v programovacím jazyce Python. (cs)
  • PyMOL ist eine freie 3D-Grafiksoftware, die zur Darstellung von Biomolekülen in der Biochemie und Bioinformatik dient. Neben der Verwendung der wichtigsten in der Strukturbiologie gebräuchlichen Datenformate erlaubt PyMOL auf verschiedenen Betriebssystemen das Rendern von Grafiken mit hoher Qualität. (de)
  • PyMOL es un visor molecular de código abierto y auspiciado por usuarios creado por y comercializado por Delano Scientific LLC, una compañía dedicada a la creación de herramientas accesibles universalmente para las comunidades científicas y educacionales. PyMOL es apropiado para producir imágenes 3D de alta calidad de moléculas pequeñas y de macromoléculas biológicas, como las proteínas. PyMOL es una de las pocas herramientas de visualización de fuente abierta disponibles para biología estructural. La parte Py de su nombre alude al hecho de que extiende a, y es extensible mediante el lenguaje de programación Python, debido a lo cual puede ser extendido para realizar análisis complejos de estructuras moleculares utilizando bibliotecas disponibles para Python como NumPy o . (es)
  • PyMOL est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D créé par Warren DeLano. Il est principalement utilisé par les étudiants, les professeurs et les chercheurs en chimie et en biologie structurale. Il est développé en Python et est multiplateformes. Ainsi, il fonctionne sous Windows, Mac OS X, Linux et les systèmes Unix. Ce logiciel est régulièrement utilisé pour produire des images 3D de grande qualité pour la publication scientifique. Selon l'auteur, environ un quart des images 3D de protéines publiées dans la littérature scientifique est réalisé avec PyMOL. (fr)
  • PyMOL is an open source but proprietary molecular visualization system created by Warren Lyford DeLano. It was commercialized initially by DeLano Scientific LLC, which was a private software company dedicated to creating useful tools that become universally accessible to scientific and educational communities. It is currently commercialized by Schrödinger, Inc. As the original software license was a permissive licence, they were able to remove it; new versions are no longer released under the Python license, but under a custom license (granting broad use, redistribution, and modification rights, but assigning copyright to any version to Schrodinger, LLC.), and some of the source code is no longer released. PyMOL can produce high-quality 3D images of small molecules and biological macromolecules, such as proteins. According to the original author, by 2009, almost a quarter of all published images of 3D protein structures in the scientific literature were made using PyMOL. PyMOL is one of the few mostly open-source model visualization tools available for use in structural biology. The Py part of the software's name refers to the program having been written in the programming language Python. PyMOL uses OpenGL Extension Wrangler Library (GLEW) and FreeGLUT, and can solve Poisson–Boltzmann equations using the Adaptive Poisson Boltzmann Solver. PyMOL used Tk for the GUI widgets and had native Aqua binaries for macOS through Schrödinger, which were replaced with a PyQt user interface on all platforms with the release of version 2.0. (en)
  • PyMOL(パイモル)はオープンソースの分子グラフィックスツールである。により開発され、個人経営のソフトフェア会社であるデラノ・サイエンティフィック (DeLano Scientific LLC) によって商品化された。現在はSchrödinger社によって商品化されている。PyMOLは小さな分子に加えてタンパク質など生体高分子の高品質な3Dイメージを作成でき、科学雑誌の表紙を飾ったPyMOLのタンパク質画像も多く存在している。 構造生物学の分野ではオープンソースで利用できる数少ないソフトフェアのうちの1つである。名称の一部Pyは記述言語であるPythonに因む。 PyMOLはOpenGL Extension Wranglerライブラリやを用いており、またプラグインとしてプログラムソフトウェアAPBSを利用してポアソン=ボルツマン方程式を解いて、タンパク質表面に電荷分布を表示させることが可能となっている。 2017年9月20日にPyMOL 2.0がリリースされた。GUIがPyQt対応になり、以前のTkやaquaを用いた描画から置き換えられた。またサポートが行われなくなったPython 2からPython 3への以降を行っており、現在のバージョンではPython 3単独で動作するようになっているが、一部の古いプラグインは依然としてPython 2でしか動作しないものも存在する。 (ja)
  • 파이몰은 워렌 라이포드 델라노에 의해 개발되었으며, 과학과 교육공동체에 널리 받아들여지는 유용한 도구들을 만들어내기 위해 만들어진 개인 소프트웨어기업인 델라노사이언티픽에 의해서 상업화된 오픈 소스, 사용자지원의 분자시각화 시스템이다. 이것은 단백질과 같은 거대분자에서 작은 분자에 이르기까지 고질의 3차원 이미지를 만들도록 잘 제작되어 있다. 제작자에 따르면, 출판된 과학논문의 단백질 3차원 영상의 25% 정도는 파이몰을 이용해서 만들어졌다. 파이몰은 구조생물학에서 유용하게 사용되는 몇 안되는 오픈 소스 시각화 도구 중 하나이다. 파이몰의 파이라는 부분은 이 소프트웨어가 파이썬으로 제작되었으며, 파이썬을 이용해 확장기능을 작성하는 것이 가능하다는 것을 나타낸다. (ko)
  • PyMOL è un software libero di grafica 3D utilizzato per la rappresentazione di biomolecole in biochimica e bioinformatica. Oltre all'uso più importante nella biologia strutturale, formati di dati comuni consentono a PyMOL di girare su sistemi operativi diversi, con un rendering della grafica di alta qualità. La parte iniziale del nome, Py, si riferisce al linguaggio di programmazione Python utilizzato dal programma. Oltre alle versioni per Linux, Microsoft Windows e macOS sono disponibili anche versioni per IRIX e Solaris. Il programma è di solito installato su singoli computer, ma può essere installato su un file server per una rete locale soprattutto su Linux e Unix. (it)
  • PyMOL é um software de computador, um sistema de visualização molecular criado por Warren Lyford DeLano. É patrocinado pelo usuário, um software de código aberto, lançado sob a Python license. Foi comercializado inicialmente pela DeLano Scientific LLC, que era uma empresa de software privada dedicada à criação de ferramentas úteis que se tornam universalmente acessíveis para comunidades científicas e educacionais. Atualmente é comercializado pela Schrödinger, Inc. PyMOL pode produzir imagens 3D de alta qualidade de moléculas e de macromoléculas biológicas, tais como proteínas. De acordo com o autor original, até 2009, quase um quarto de todas as imagens publicadas de estruturas de proteínas 3D na literatura científica foram feitas usando o PyMOL. (pt)
  • PyMOL是一个开放源码,由使用者贊助的分子三维结构显示软件。由Warren Lyford DeLano编写,並且由DeLano Scientific LLC將它商業化。DeLano Scientific LLC是一個私人的軟體公司,它致力於創造讓普遍的科學與教育社群都能取得的好用軟體工具。 PyMOL适用于创作高品質的小分子或是生物大分子(特别是蛋白質)的三维结构圖像。軟體的作者宣称,在所有正式发表的科學文獻中的蛋白質結構圖像中,有四分之一是使用PyMOL來製作。 PyMOL是少數可以用在結構生物学领域的开放源代码視覺化工具。 軟體以Py+MOL命名:“Py”表示它是由一种计算机语言Python所衍生出來的,“MOL”表示它是用于显示分子(英文为molecule)结构的软件。 (zh)
  • PyMOL — система визуализации молекул. Позволяет создавать высококачественные трёхмерные изображения как малых молекул, так и биологических макромолекул, в первую очередь белков. Примерно четверть всех публикуемых в научной литературе изображений структур белков сделана с помощью PyMOL. PyMOL — одна из немногих систем молекулярной визуализации с открытым исходным кодом, пригодная для использования в структурной биологии. (ru)
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  • A PyMOL instance, with the Viewer and GUI visible. (en)
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  • Originally the Python License, now proprietary (en)
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  • PyMOL logo.svg (en)
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  • PyMOL (en)
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  • PyMOL ist eine freie 3D-Grafiksoftware, die zur Darstellung von Biomolekülen in der Biochemie und Bioinformatik dient. Neben der Verwendung der wichtigsten in der Strukturbiologie gebräuchlichen Datenformate erlaubt PyMOL auf verschiedenen Betriebssystemen das Rendern von Grafiken mit hoher Qualität. (de)
  • PyMOL est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D créé par Warren DeLano. Il est principalement utilisé par les étudiants, les professeurs et les chercheurs en chimie et en biologie structurale. Il est développé en Python et est multiplateformes. Ainsi, il fonctionne sous Windows, Mac OS X, Linux et les systèmes Unix. Ce logiciel est régulièrement utilisé pour produire des images 3D de grande qualité pour la publication scientifique. Selon l'auteur, environ un quart des images 3D de protéines publiées dans la littérature scientifique est réalisé avec PyMOL. (fr)
  • PyMOL(パイモル)はオープンソースの分子グラフィックスツールである。により開発され、個人経営のソフトフェア会社であるデラノ・サイエンティフィック (DeLano Scientific LLC) によって商品化された。現在はSchrödinger社によって商品化されている。PyMOLは小さな分子に加えてタンパク質など生体高分子の高品質な3Dイメージを作成でき、科学雑誌の表紙を飾ったPyMOLのタンパク質画像も多く存在している。 構造生物学の分野ではオープンソースで利用できる数少ないソフトフェアのうちの1つである。名称の一部Pyは記述言語であるPythonに因む。 PyMOLはOpenGL Extension Wranglerライブラリやを用いており、またプラグインとしてプログラムソフトウェアAPBSを利用してポアソン=ボルツマン方程式を解いて、タンパク質表面に電荷分布を表示させることが可能となっている。 2017年9月20日にPyMOL 2.0がリリースされた。GUIがPyQt対応になり、以前のTkやaquaを用いた描画から置き換えられた。またサポートが行われなくなったPython 2からPython 3への以降を行っており、現在のバージョンではPython 3単独で動作するようになっているが、一部の古いプラグインは依然としてPython 2でしか動作しないものも存在する。 (ja)
  • 파이몰은 워렌 라이포드 델라노에 의해 개발되었으며, 과학과 교육공동체에 널리 받아들여지는 유용한 도구들을 만들어내기 위해 만들어진 개인 소프트웨어기업인 델라노사이언티픽에 의해서 상업화된 오픈 소스, 사용자지원의 분자시각화 시스템이다. 이것은 단백질과 같은 거대분자에서 작은 분자에 이르기까지 고질의 3차원 이미지를 만들도록 잘 제작되어 있다. 제작자에 따르면, 출판된 과학논문의 단백질 3차원 영상의 25% 정도는 파이몰을 이용해서 만들어졌다. 파이몰은 구조생물학에서 유용하게 사용되는 몇 안되는 오픈 소스 시각화 도구 중 하나이다. 파이몰의 파이라는 부분은 이 소프트웨어가 파이썬으로 제작되었으며, 파이썬을 이용해 확장기능을 작성하는 것이 가능하다는 것을 나타낸다. (ko)
  • PyMOL é um software de computador, um sistema de visualização molecular criado por Warren Lyford DeLano. É patrocinado pelo usuário, um software de código aberto, lançado sob a Python license. Foi comercializado inicialmente pela DeLano Scientific LLC, que era uma empresa de software privada dedicada à criação de ferramentas úteis que se tornam universalmente acessíveis para comunidades científicas e educacionais. Atualmente é comercializado pela Schrödinger, Inc. PyMOL pode produzir imagens 3D de alta qualidade de moléculas e de macromoléculas biológicas, tais como proteínas. De acordo com o autor original, até 2009, quase um quarto de todas as imagens publicadas de estruturas de proteínas 3D na literatura científica foram feitas usando o PyMOL. (pt)
  • PyMOL是一个开放源码,由使用者贊助的分子三维结构显示软件。由Warren Lyford DeLano编写,並且由DeLano Scientific LLC將它商業化。DeLano Scientific LLC是一個私人的軟體公司,它致力於創造讓普遍的科學與教育社群都能取得的好用軟體工具。 PyMOL适用于创作高品質的小分子或是生物大分子(特别是蛋白質)的三维结构圖像。軟體的作者宣称,在所有正式发表的科學文獻中的蛋白質結構圖像中,有四分之一是使用PyMOL來製作。 PyMOL是少數可以用在結構生物学领域的开放源代码視覺化工具。 軟體以Py+MOL命名:“Py”表示它是由一种计算机语言Python所衍生出來的,“MOL”表示它是用于显示分子(英文为molecule)结构的软件。 (zh)
  • PyMOL — система визуализации молекул. Позволяет создавать высококачественные трёхмерные изображения как малых молекул, так и биологических макромолекул, в первую очередь белков. Примерно четверть всех публикуемых в научной литературе изображений структур белков сделана с помощью PyMOL. PyMOL — одна из немногих систем молекулярной визуализации с открытым исходным кодом, пригодная для использования в структурной биологии. (ru)
  • PyMOL és un visor molecular de codi obert creat per i comercialitzat per , una companyia dedicada a la creació d'eines accessibles universalment per a les comunitats científiques i educatives. PyMOL és apropiat per a reproduir imatges 3D d'alta qualitat de molècules petites i de macromolècules biològiques, com les proteïnes. (ca)
  • PyMOL je neziskový multiplatformní software s open source licencí sponzorovaný samotnými uživateli. Své využití nachází v biochemických oborech zabývajících se strukturou biopolymerů (DNA, RNA, proteiny), jejich vzájemnými interakcemi apod. PyMOL slouží ke grafickému zobrazování, sdílení a analýze molekulárních dat získaných nejčastěji měřením buď metodou NMR spektroskopie, nebo X-ray krystalografie. Pro práci s těmito daty je využíván formát souboru .pdb. Jednou z nejpoužívanějších databází molekulárních dat je databáze Protein data bank (odtud zkratka PDB a formát .pdb), která k roku 2017 obsahuje přes 136 000 struktur. (cs)
  • PyMOL es un visor molecular de código abierto y auspiciado por usuarios creado por y comercializado por Delano Scientific LLC, una compañía dedicada a la creación de herramientas accesibles universalmente para las comunidades científicas y educacionales. PyMOL es apropiado para producir imágenes 3D de alta calidad de moléculas pequeñas y de macromoléculas biológicas, como las proteínas. (es)
  • PyMOL is an open source but proprietary molecular visualization system created by Warren Lyford DeLano. It was commercialized initially by DeLano Scientific LLC, which was a private software company dedicated to creating useful tools that become universally accessible to scientific and educational communities. It is currently commercialized by Schrödinger, Inc. As the original software license was a permissive licence, they were able to remove it; new versions are no longer released under the Python license, but under a custom license (granting broad use, redistribution, and modification rights, but assigning copyright to any version to Schrodinger, LLC.), and some of the source code is no longer released. PyMOL can produce high-quality 3D images of small molecules and biological macromole (en)
  • PyMOL è un software libero di grafica 3D utilizzato per la rappresentazione di biomolecole in biochimica e bioinformatica. Oltre all'uso più importante nella biologia strutturale, formati di dati comuni consentono a PyMOL di girare su sistemi operativi diversi, con un rendering della grafica di alta qualità. La parte iniziale del nome, Py, si riferisce al linguaggio di programmazione Python utilizzato dal programma. (it)
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  • PyMOL (ca)
  • PyMOL (cs)
  • PyMOL (de)
  • PyMOL (es)
  • PyMOL (fr)
  • PyMOL (it)
  • PyMOL (ja)
  • 파이몰 (ko)
  • PyMOL (en)
  • PyMOL (pt)
  • PyMOL (ru)
  • PyMOL (zh)
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