Apolipoprotein F je protein koji je kod ljudi kodiran genom APOF.[5][6]

APOF
Identifikatori
AliasiAPOF
Vanjski ID-jeviOMIM: 107760 MGI: 104539 HomoloGene: 48030 GeneCards: APOF
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za APOF
Genomska lokacija za APOF
Bend12q13.3Početak56,360,568 bp[1]
Kraj56,362,857 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za APOF
Genomska lokacija za APOF
Bend10 D3|10 76.5 cMPočetak128,103,866 bp[2]
Kraj128,106,022 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija cholesterol binding
signaling receptor binding
lipid transporter activity
Ćelijska komponenta low-density lipoprotein particle
high-density lipoprotein particle
extracellular region
Vanćelijsko
Biološki proces steroid metabolic process
lipid transport
cholesterol metabolic process
lipid metabolism
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001638

NM_133997

RefSeq (bjelančevina)

NP_001629

NP_598758

Lokacija (UCSC)Chr 12: 56.36 – 56.36 MbChr 10: 128.1 – 128.11 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš
Apolipoprotein F
Identifikatori
SimbolAPOF

Proizvod ovog gena jedan je od manjih apolipoproteina pronađenih u plazmi. Ovaj protein formira multiproteinska komplekse sa lipoproteinima i može biti uključen u transport i/ili esterifikaciju holesterola.[6]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 326 aminokiselina, a molekulska težina 35.399 Da.[7]

1020304050
MTGLCGYSAPDMRGLRLIMIPVELLLCYLLLHPVDATSYGKQTNVLMHFP
LSLESQTPSSDPLSCQFLHPKSLPGFSHMAPLPKFLVSLALRNALEEAGC
QADVWALQLQLYRQGGVNATQVLIQHLRGLQKGRSTERNVSVEALASALQ
LLAREQQSTGRVGRSLPTEDCENEKEQAVHNVVQLLPGVGTFYNLGTALY
YATQNCLGKARERGRDGAIDLGYDLLMTMAGMSGGPMGLAISAALKPALR
SGVQQLIQYYQDQKDANISQPETTKEGLRAISDVSDLEETTTLASFISEV
VSSAPYWGWAIIKSYDLDPGAGSLEI

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000175336 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000047631 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Day JR, Albers JJ, Gilbert TL, Whitmore TE, McConathy WJ, Wolfbauer G (Oct 1994). "Purification and molecular cloning of human apolipoprotein F". Biochem Biophys Res Commun. 203 (2): 1146–51. doi:10.1006/bbrc.1994.2302. PMID 8093033.
  6. ^ a b "Entrez Gene: APOF apolipoprotein F".
  7. ^ "UniProt, Q13790". Pristupljeno 6. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi
  NODES
Project 1