FANCB
Protein grupe B Fanconijeve anemije jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FANCB sa hromosoma X.[5][6][7]
Aminokiselinska sekvenca
urediDužina polipeptidnog lanca je 859 aminokiselina, a molekulska težina 97.726 Da.[7]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MTSKQAMSSN | EQERLLCYNG | EVLVFQLSKG | NFADKEPTKT | PILHVRRMVF | ||||
| DRGTKVFVQK | STGFFTIKEE | NSHLKIMCCN | CVSDFRTGIN | LPYIVIEKNK | ||||
| KNNVFEYFLL | ILHSTNKFEM | RLSFKLGYEM | KDGLRVLNGP | LILWRHVKAF | ||||
| FFISSQTGKV | VSVSGNFSSI | QWAGEIENLG | MVLLGLKECC | LSEEECTQEP | ||||
| SKSDYAIWNT | KFCVYSLESQ | EVLSDIYIIP | PAYSSVVTYV | HICATEIIKN | ||||
| QLRISLIALT | RKNQLISFQN | GTPKNVCQLP | FGDPCAVQLM | DSGGGNLFFV | ||||
| VSFISNNACA | VWKESFQVAA | KWEKLSLVLI | DDFIGSGTEQ | VLLLFKDSLN | ||||
| SDCLTSFKIT | DLGKINYSSE | PSDCNEDDLF | EDKQENRYLV | VPPLETGLKV | ||||
| CFSSFRELRQ | HLLLKEKIIS | KSYKALINLV | QGKDDNTSSA | EEKECLVPLC | ||||
| GEEENSVHIL | DEKLSDNFQD | SEQLVEKIWY | RVIDDSLVVG | VKTTSSLKLS | ||||
| LNDVTLSLLM | DQAHDSRFRL | LKCQNRVIKL | STNPFPAPYL | MPCEIGLEAK | ||||
| RVTLTPDSKK | EESFVCEHPS | KKECVQIITA | VTSLSPLLTF | SKFCCTVLLQ | ||||
| IMERESGNCP | KDRYVVCGRV | FLSLEDLSTG | KYLLTFPKKK | PIEHMEDLFA | ||||
| LLAAFHKSCF | QITSPGYALN | SMKVWLLEHM | KCEIIKEFPE | VYFCERPGSF | ||||
| YGTLFTWKQR | TPFEGILIIY | SRNQTVMFQC | LHNLIRILPI | NCFLKNLKSG | ||||
| SENFLIDNMA | FTLEKELVTL | SSLSSAIAKH | ESNFMQRCEV | SKGKSSVVAA | ||||
| ALSDRRENIH | PYRKELQREK | KKMLQTNLKV | SGALYREITL | KVAEVQLKSD | ||||
| FAAQKLSNL |
Funkcija
urediFanconijeva grupa za komplementarnu anemiju (FANC) uključuje FANCA, FANCB, FANCC, FANCD1 (također zvana BRCA2), FANCD2, FANCE, FANCF , FANCG i FANCL. Fanconijeva anemija je genetički heterogeni recesivni poremećaj karakteriziran citogenetičkom nestabilnošću, preosjetljivošću na agense za umrežavanje DNK, povećanim lomovima hromosoma i defektnom popravkom DNK. Članovi grupe za komplementaciju anemije Fanconi ne dijele sličnost sekvenci; oni su povezani svojim sklapanjem u zajednički jedarni proteinski kompleks. Ovaj gen kodira protein za FANCB. Alternativna prerada rezultira u dvije varijante transkripta koje kodiraju isti protein.[7]
Gen
urediFANCB je jedini gen za koji se zna da uzrokuje X-vezanu Fanconijevu anemiju. Kod ženskih nositelja mutacija FANCB (jedan divlji tip alela FANCB i jedan mutantni alel FANCB) postoji jaka selekcija putem X-inaktivacija za ekspresiju samo alela divljeg tipa.[8] Nasuprot tome, muškarci imaju samo jedan alel FANCB. Samo muški pacijenti sa Fanconijevom anemijom su ikada bili povezani sa FANCB mutacijama, i oni čine oko 4% slučajeva.[9]
Mutacije u FANCB su u velikoj mjeri povezane s razvojem VACTERL-H konstilacije urođenih mahana.[10] U kohortnoj studiji od 19 djece s FANCB varijantama, ona s delecijom gena FANCB ili skraćenjem FANCB proteina pokazuju početak zatajenja koštane srži ranije od prosjeka i teže kongenitalne abnormalnosti u poređenju s velikom serijom osoba s Fanconijevom anemijom u objavljenim izvještajima. Ovo odražava nezamjenjivu ulogu gena FANCB u ćelijama. Za varijante promašaja FANCB-a, varijabilnija ozbiljnost je povezana sa obimom preostale aktivnosti.[11]
Protein
urediProizvod gena FANCB je protein FANCB. FANCB je komponenta "osnovnog kompleksa" od devet proteina Fanconijeve anemije: FANCA, FANCB, FANCC, FANCE, FANCF, FANCG, FANCL, FAAP100 i FAAP20. Kompleks jezgra se lokalizuje na mesta oštećenja DNK tokom replikacija DNK, gde katalizuje transfer ubikvitina na FANCD2 i FANCI.[12] Konkretno, ova reakcija je neophodna za popravku međulančanih poprečnih veza DNK, kao što su one koje formiraju lijekovi za hemoterapiju, cisplatin, mitomicin c i melfalan.[13]
Unutar kompleksa jezgra Fanconijev anemije, FANCB ima obaveznu interakciju sa FAAP100 i FANCL, kako bi se formirao katalitički enzim E3 RING-ligaza. FANCB stvara dimerni interfejs unutar ovog potkompleksa koji je neophodan za istovremenu ubikvitinaciju FANCD2 i FANCI.[14] Elektronsko mikroskopsko snimanje kompleksa FANCB-FANCL-FAAP100 otkrilo je simetriju koja je usredsređena na FANCB, a biohemijsko istraživanje je potvrdilo da je cijeli kompleksni dimer koji sadrži po dvije od svake podjedinice.[15] Further imaging reveals the overall architecture of the Fanconi Anemia core complex centres on FANCB protein.[15]
FANCB mutantni miševi su neplodni i pokazuju defekte primordijalnih germinativnih ćelija tokom embriogeneze. Zametne ćelije i veličina testisa su ozbiljno ugrožene kod FANCB mutantnih miševa.[16] Protein FANCB je neophodan za spermatogenezu i verovatno ima ulogu u aktivaciji puta popravka DNK Fanconijeve anemije tokom mejoze.[16]
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000181544 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000047757 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Joenje H, Oostra AB, Wijker M, di Summa FM, van Berkel CG, Rooimans MA, Ebell W, van Weel M, Pronk JC, Buchwald M, Arwert F (Nov 1997). "Evidence for at least eight Fanconi anemia genes". Am J Hum Genet. 61 (4): 940–4. doi:10.1086/514881. PMC 1715980. PMID 9382107.
- ^ Meetei AR, Levitus M, Xue Y, Medhurst AL, Zwaan M, Ling C, Rooimans MA, Bier P, Hoatlin M, Pals G, de Winter JP, Wang W, Joenje H (Oct 2004). "X-linked inheritance of Fanconi anemia complementation group B". Nat Genet. 36 (11): 1219–24. doi:10.1038/ng1458. PMID 15502827.
- ^ a b c "Entrez Gene: FANCB Fanconi anemia, complementation group B".
- ^ Meetei AR, Levitus M, Xue Y, Medhurst AL, Zwaan M, Ling C, Rooimans MA, Bier P, Hoatlin M, Pals G, de Winter JP, Wang W, Joenje H (novembar 2004). "X-linked inheritance of Fanconi anemia complementation group B". Nature Genetics. 36 (11): 1219–24. doi:10.1038/ng1458. PMID 15502827.
- ^ Wang AT, Smogorzewska A (januar 2015). "SnapShot: Fanconi anemia and associated proteins". Cell. 160 (1–2): 354–354.e1. doi:10.1016/j.cell.2014.12.031. PMID 25594185.
- ^ Fiesco-Roa MO, Giri N, McReynolds LJ, Best AF, Alter BP (septembar 2019). "Genotype-phenotype associations in Fanconi anemia: A literature review". Blood Reviews. 37: 100589. doi:10.1016/j.blre.2019.100589. PMC 6730648. PMID 31351673.
- ^ Jung M, Ramanagoudr-Bhojappa R, van Twest S, Rosti RO, Murphy V, Tan W, et al. (april 2020). "Association of clinical severity with FANCB variant type in Fanconi anemia". Blood. 135 (18): 1588–1602. doi:10.1182/blood.2019003249. PMC 7193183. PMID 32106311.
- ^ Walden H, Deans AJ (2014). "The Fanconi anemia DNA repair pathway: structural and functional insights into a complex disorder". Annual Review of Biophysics. 43: 257–78. doi:10.1146/annurev-biophys-051013-022737. PMID 24773018.
- ^ Ceccaldi R, Sarangi P, D'Andrea AD (juni 2016). "The Fanconi anaemia pathway: new players and new functions". Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 17 (6): 337–49. doi:10.1038/nrm.2016.48. PMID 27145721. S2CID 1712640.
- ^ van Twest S, Murphy VJ, Hodson C, Tan W, Swuec P, O'Rourke JJ, Heierhorst J, Crismani W, Deans AJ (januar 2017). "Mechanism of Ubiquitination and Deubiquitination in the Fanconi Anemia Pathway". Molecular Cell. 65 (2): 247–259. doi:10.1016/j.molcel.2016.11.005. PMID 27986371.
- ^ a b Swuec P, Renault L, Borg A, Shah F, Murphy VJ, van Twest S, Snijders AP, Deans AJ, Costa A (januar 2017). "The FA Core Complex Contains a Homo-dimeric Catalytic Module for the Symmetric Mono-ubiquitination of FANCI-FANCD2". Cell Reports. 18 (3): 611–623. doi:10.1016/j.celrep.2016.11.013. PMC 5266791. PMID 27986592.
- ^ a b Kato Y, Alavattam KG, Sin HS, Meetei AR, Pang Q, Andreassen PR, Namekawa SH (2015). "FANCB is essential in the male germline and regulates H3K9 methylation on the sex chromosomes during meiosis". Hum. Mol. Genet. 24 (18): 5234–49. doi:10.1093/hmg/ddv244. PMC 4550819. PMID 26123487.