RNA polymeráza
RNA polymeráza (RNAP) je enzym, který katalyzuje syntézu RNA podle vzoru - příslušné části řetězce DNA (či vzácně podle jiné RNA). Díky tomuto enzymu vznikají mezi danými nukleosidtrifosfáty (ATP, CTP, GTP, UTP) fosfodiesterové vazby, čímž se spojují do řetězce několika tisíc nukleotidů. RNA polymeráza hraje klíčovou roli v procesu transkripce.[1]
RNA polymeráza udělá chybu jednou za 104 nukleotidů, tedy asi 1 000× častěji, než DNA polymeráza (po proofreadingu).[1] Regulaci transkripce zajišťují zejména tzv. transkripční faktory, které se mnohdy vážou na RNA polymerázu.
Klasifikace
editovatRozlišují se:[2]
- DNA-dependentní RNA polymerázy – vzorem pro jejich činnost je řetězec DNA
- RNA-dependentní RNA polymerázy – vzorem pro jejich činnost je řetězec RNA, jedná se spíše o výjimku.
Typy RNA polymeráz
editovatU bakterií
editovatBakterie mají zřejmě jedinou RNA polymerázu, ta je však složená z několika podjednotek:[2]
- α podjednotka (velikost 36,5 kDa) – váže se na promotor;
- β′ podjednotka (155,2 kDa) – váže se na DNA;
- β podjednotka (150,6 kDa) – umožňuje samotnou polymerizační aktivitu
- σ podjednotka (sigma faktor) – významná pro iniciaci transkripce (otevře dvoušroubovici).
U eukaryot
editovatU eukaryot jsou tři základní typy RNA-polymeráz,[1] všechny jsou složené z mnoha podjednotek (například RNAP jich má kolem 12[2]):
- RNA polymeráza I - přepisuje většinu rRNA
- RNA polymeráza II - přepisuje všechnu DNA přepisovanou na proteiny a některé malé jaderné RNA (například RNA přítomnou v spliceozomech)
- RNA polymeráza III - přepisuje tRNA, část rRNA a některé malé strukturní RNA
U rostlin se vyskytuje navíc i tzv. RNA polymeráza IV (přepisuje siRNA).[3]
Archea mají zřejmě jen jedinou RNA polymerázu, nápadně podobnou těm eukaryotickým.[4]
Odkazy
editovatReference
editovat- ↑ a b c ALBERTS, Bruce, et al. Essential Cell Biology. 2. vyd. New York: Garland Science, 2004. Dostupné online.
- ↑ a b c RÉDEI, George P. Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics. 3rd Edition. vyd. [s.l.]: Springer, 2008. ISBN 978-1-4020-6753-2.
- ↑ Herr AJ, Jensen MB, Dalmay T, Baulcombe DC. RNA polymerase IV directs silencing of endogenous DNA. Science. 2005, roč. 308, čís. 5718, s. 118–20. DOI 10.1126/science.1106910. PMID 15692015.
- ↑ D Langer, J Hain, P Thuriaux and W Zillig (1995) Transcription in Archaea: Similarity to that in Eucarya PNAS 92 5768-5772
Související články
editovatExterní odkazy
editovat
Obrázky, zvuky či videa k tématu RNA polymeráza na Wikimedia Commons
