Épidémie de variole du singe de 2022-2023

L'épidémie de variole du singe de 2022-2023 apparaît le au Royaume-Uni chez un individu de retour du Nigeria[1],[2].

Épidémie de variole du singe de 2022
Transmission du virus de la variole du singe (en vert) vue au microscope électronique.
Maladie
Agent infectieux
Virus de la variole du singe
Origine
Localisation
Royaume-Uni, Portugal, Espagne, États-Unis, Canada, Italie, Suède, Belgique, France, Allemagne, Australie, Pays-Bas, Israël, Suisse, Grèce, Norvège, Autriche, Pologne, Argentine, Danemark, Pakistan, Maroc, Tchéquie, Slovénie, Émirats arabes unis, Finlande, Soudan, Irlande, Iran, Malte, Mexique, Bolivie, Brésil, Thaïlande, Hongrie, Haïti, Paraguay, Maurice, Uruguay, Lettonie, Kosovo, Colombie, Bahamas, Bangladesh, Ouganda, Ghana, Islande, Venezuela, Roumanie, Slovaquie, Géorgie, Luxembourg, Népal, Serbie, Chili, Liban, Singapour, Somalie, Corée du Sud, Taïwan, Afrique du Sud, Zambie, Libye, Fidji, Bulgarie, Croatie, Estonie, Pérou, Turquie, Panama, Jamaïque, Japon, Andorre, République dominicaine, Nouvelle-Zélande, Russie, Bosnie-Herzégovine, Inde, Arabie saoudite, Barbade, Qatar, Monaco, Philippines, Équateur, Bénin, république populaire de Chine, Égypte, Groenland, Guatemala, Guyana, Honduras, Indonésie, Jordanie, Liberia, Lituanie, Moldavie, UkraineVoir et modifier les données sur Wikidata
Premier cas
Date d'arrivée
Date de fin
Bilan
Cas suspectés
9 440
Cas confirmés
68 265
Hospitalisations
31 ()Voir et modifier les données sur Wikidata
Morts
136

Au , plus de 300 cas de variole du singe étaient confirmés ou soupçonnés en Europe, en Amérique et en Australie, selon le décompte réalisé quotidiennement[3] par une équipe internationale d'épidémiologistes[4].

Le vaccin antivariolique de 3e génération MVA-BN du Danois Bavarian Nordic (en) (IMVANEX en Europe, JYNNEOS aux États-Unis ou IMVAMUNE au Canada) voit son indication élargie à la variole du singe[5].

En 2024 une nouvelle souche du virus plus contagieuse et plus mortelle se développe en Afrique (la clade lb), donnant lieu à une nouvelle épidémie.

Propagation du virus

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Au début du mois de , trois cas sont d'abord signalés au Royaume-Uni — probablement par un cas importé d'un voyageur revenant du Nigeria —[1],[2],[6], puis 23 cas suspectés en Espagne et au Portugal[7]. L'agence sanitaire publique des États-Unis, le centre pour le contrôle et la prévention des maladies (CDC), affirme s'inquiéter d'une transmission communautaire au-delà du Royaume-Uni[8]. Des cas sont ensuite confirmés au Canada[9] et aux États-Unis[10], en Argentine, ainsi qu'en Italie[11], aux Pays-Bas[12], en Belgique[13], en France[14], en Suède[15], en Norvège[16], au Danemark[17], en Allemagne[18], en Suisse[19], en Autriche[20], en Grèce[21], en Israël[22] et en Australie[23]. Selon l'Organisation mondiale de la santé (OMS), la plupart des cas concernent les relations homosexuelles masculines[22], le risque de contagion étant plus élevé chez les personnes ayant plusieurs partenaires sexuels, tout en restant « très faible » dans la population en général[24]. Le , l'OMS affirme que la propagation peut être stoppée dans les pays où le virus n'est pas encore endémique[24]. Une première analyse génomique menée sur un cas confirmé au Portugal identifie la souche ouest-africaine comme à l'origine de l'infection et les génomes viraux connus les plus proches seraient ceux des cas exportés du Nigeria en 2018-2019 vers le Royaume-Uni, Israël et Singapour[25]. Un autre génome de virus, séquencé sur un patient aux États-Unis, correspond à celui identifié au Portugal[26]. Depuis, deux variants issus de cette souche ouest-africaine ont été identifiés en Europe[27].

Chez l'humain, le virus n'a jamais été détecté hors d'Afrique avant 2003.

En , le schéma de propagation du virus est encore incompris et intrigue les épidémiologistes car il diffère des épidémies du passé hors de l'Afrique. Presque toutes les épidémies précédentes avaient pu être expliquées par l'import du virus par des vols venant d'Afrique, ou par une exposition directe à des animaux exotiques infectés (cas le plus fréquent)[28].

Le , le Nigeria annonce le premier mort lié à la maladie[29]. En Europe, le premier décès lié à la maladie a lieu en Espagne le [30]. Le même jour, c'est le Brésil qui déclarait plus tôt un décès sur son sol, le premier mort hors du continent africain[31].

Le , l'Organisation mondiale de la santé déclare l'épidémie de la variole du singe en cours comme une urgence de santé publique de portée internationale[32].

En France, le pic de l'épidémie a eu lieu en juillet 2022, le nombre de personnes contaminées a très fortement diminué ensuite, pour à partir de novembre 2022 être assez marginal[33].

Facteurs de risques

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Depuis la fin du XXe siècle, des épidémies de variole du singe ont été plus fréquentes et ont sévi dans 11 pays africains (en République démocratique du Congo principalement)[34]. Cette augmentation pourrait avoir deux explications :

  • une diminution de l'immunité globale de la population contre la variole (maladie dont le virus est proche de celui du monkeypox) depuis la fin des programmes de vaccination contre la variole[35]. Un indice plaidant pour cette explication est qu'en Afrique les enfants victimes de la variole du singe font généralement partie de ceux qui n'ont pas été vaccinés contre la variole[35] ;
  • des changements croissant d'utilisation des terres mettent davantage de personnes à proximité d'animaux porteurs du virus[28].

Risque d'infection de la faune sauvage

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Fin , le groupe britannique Human Animal Infections and Risk Surveillance (HAIRS)[36] met en garde contre le fait que le virus pourrait atteindre la faune sauvage et devenir ainsi endémique[37],[38].

Pays touchés

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Carte de la propagation globale du virus de la variole du singe.

  • Pas de cas connu
  • Clade ouest-africain endémique
  • Clade centrafricain endémique
  • Les deux clades
  • Épidémie de variole du singe de 2022
  • Cas suspectés
Cas par pays et territoire
Pays Confirmé Suspecté Total Morts Dernière mise à jour Premier cas confirmé
  Afghanistan _ _ _ 28 mai 2022[39],[40] _
  Andorre 1 _ 1 2 juli 2022 2 juli 2022
  Angola _ _ _ 5 juin 2022 5 juin 2022
  Arménie _ _ _ 25 juin 2022 _
  Algérie _ _ _ 17 juin 2022 _
  Afrique du Sud 1 _ 1 23 juin 2022 23 juin 2022
  Arabie saoudite _ _ _ 9 juin 2022 9 juin 2022
  Argentine 4 2 6 27 mai 2022[41] 26 mai 2022[41]
  Australie 13 _ 13 4 juin 2022[42] 20 mai 2022[43]
  Autriche 20 _ 20 22 mai 2022 22 mai 2022
  Azerbaïdjan _ 7 7 6 juin 2022 _
  Bahamas _ 1 1 8 juin 2022 _
  Bangladesh _ _ _ 7 juin 2022 _
  Belgique 77 _ 77 3 juin 2022[44] 19 mai 2022 [45]
  Bolivie _ 1 1 26 mai 2022[46]  —
  Bhoutan _ 1 1 1 juli 2022 _
  Brésil 2985 9 2985 1[47] 18 aout 2022[48] 8 juin 2022[49]
  Bulgarie 2 - 2 23 juin 2022[50] 23 juin 2022[50]
  Cameroun 37 3 40 23 juin 2022 18 mai 2022
  République centrafricaine 15 11 26 2 23 juin 2022 16 mai 2022
  Canada 905 44 279 3 juin 2022[51],[52],[53] 19 mai 2022[54]
  Chili 3 - 3 17 juin 2022[55] 17 juin 2022[55]
  Colombie 3 - 3 23 juin 2022[56] 23 juin 2022[56]
  République démocratique du Congo 1533 83 1616 22 juin 2022 7 mai 2022
  République du Congo 2 8 10 23 juin 2022 28 mai 2022
  Costa Rica _ _ _ 1 juin 2022[57] _
  Corée du Sud 1 _ 1 22 juin 2022 22 juin 2022
  Danemark 13 _ 13 3 juin 2022[58] 23 mai 2022
  République dominicaine 1 _ 1 6 juli 2022 6 juli 2022
  Estonie 1 _ 1 28 juin 2022[59] 28 juin 2022[59]
  Équateur 19 _ 19 1 18 aout 2022[48] _
  Fidji _ 1 1 24 juin 2022 _
  Finlande 4 _ 4 2 juin 2022[60] 27 mai 2022
  France 2749 _ 2749 16 aout 2022[61] 20 mai 2022[62]
  Guyane _ 2 2 26 mai 2022[63] _
  Géorgie 1 _ 1 15 juin 2022[64] 15 juin 2022[64]
  Allemagne 3187 _ 3187 18 aout 2022[48] 20 mai 2022[65]
  Ghana 47 _ 47

1

18 aout 2022[48] 8 juin 2022[66]
  Grèce 3 _ 3 8 juin 2022[67],[68] 8 juin 2022[68]
  Haïti _ 1 1 1 juin 2022[69] _
  Honduras 1 3 4 3 juli 2022 _
  Croatie 1 _ 1 22 juin 2022 _
  Hongrie 12 _ 12 31 mai 2022[70] 31 mai 2022[70]
  Inde _ _ _ 1[71] 4 juin 2022[72] _
  Iran _ 3 3 28 mai 2022[73] _
  Irlande 28 _ 28 1 juin 2022[74] 28 mai 2022[75]
  Islande 3 _ 3 15 juin 2022[76] 9 juin 2022[77]
  Israël 16 _ 16 22 mai 2022[78] 21 mai 2022[79]
  Italie 692 1 692 18 aout 2022[48] 19 mai 2022[80]
  Jamaïque 1 _ 1 6 juli 2022 6 juli 2022
  Jersey 1 _ 1 23 juli 2022 23 juli 2022
  Kosovo _ _ _ 4 juin 2022 _
  Koweït 2 _ 2 12 juli 2022 2 juli 2022
  Laos _ _ _ 20 juin 2022 _
  Lettonie 2 _ 2 3 juin 2022[81] 3 juin 2022[81]
  Liban 1 _ 1 20 juin 2022[82] 20 juin 2022[82]
  Libye _ _ _ 16 juin 2022 _
  Luxembourg 1 _ 1 16 juin 2022[83] 15 juin 2022[83]
  Malte 4 _ 4 28 mai 2022[84] 28 mai 2022[85]
  Maldives _ _ _ 18 juin 2022 _
  Maroc 1 _ 1 2 juin 2022[86] 2 juin 2022[87]
  Martinique _ _ _ 19 juin 2022 _
  Maurice _ _ _ 2 juin 2022[88] _
  Mexique 9 _ 9 28 mai 2022[89] 28 mai 2022[89]
  Saint-Martin _ _ _ 16 juin 2022 _
  Macédoine du Nord 1 _ 1 19 juin 2022 19 juin 2022
  Mongolie _ _ _ 21 juin 2022 _
  Monaco _ _ _ 8 juin 2022 8 juin 2022
  Namibie _ _ _ 19 juin 2022 _
  Népal _ _ _ 16 juin 2022[90] _
  Nigeria 172 66 172 4[29] 18 aout 2022[29],[48]
  Norvège 74 _ 74 18 aout 2022[48] 31 mai 2022[91]
  Nouvelle-Calédonie 1 _ 1 12 juli 2022 12 juli 2022
  Nouvelle-Zélande 1 _ 1 10 juin 2022 10 juin 2022
  Ouganda _ 6 6 8 juin 2022[92] _
  Panama 1 _ 1 5 juli 2022[93] 5 juli 2022[93]
  Paraguay _ 1 1 1 juin 2022[94] _
  Pays-Bas 211 _ 211 2 juin 2022[95] 20 mai 2022[96]
  Pérou 1 _ 1 1[71] 26 juin 2022 [97] 26 juin 2022 [97]
  Pologne 12 _ 12 10 juin 2022[98] 10 juin 2022[98]
  Portugal 348 _ 348 6 juin 2022[99] 18 mai 2022[100]
  Porto Rico 1 _ 1 29 juin 2022[101] 29 juin 2022[101]
  Qatar 2 _ 2 20 juli 2022 20 juli 2022
  Roumanie 5 _ 5 13 juin 2022[102] 13 juin 2022[102]
  Russie 1 _ 1 12 juli 2022
  Rwanda _ 1 1 5 juli 2022
  Sénégal _ _ _ 10 juin 2022 _
  Serbie 1 _ 1 17 juin 2022[103] 17 juin 2022[103]
  Singapour 1 _ 1 21 juin 2022[104] 20 juin 2022[104]
  Sierra Leone 2 8 10 23 juin 2022 14 mai 2022
  Somalie _ 3 3 15 juin 2022 _
  Espagne 5792 _ 5792 2 18 aout 2022[48] 18 mai 2022[105]
  Slovaquie _ _ _ 14 juin 2022 _
  Sri Lanka _ _ _ 22 juin 2022 _
  Slovénie 8 _ 8 2 juin 2022[106] 25 mai 2022
  Soudan _ 3 3 26 mai 2022[107] _
  Suède 130 _ 130 18 aout 2022[48] 19 mai 2022
  Suisse 388 _ 388 18 aout 2022[48] 21 mai 2022[108]
  Eswatini _ _ _ 18 juin 2022 _
  Taïwan 1 _ 1 24 juin 2022 24 juin 2022
  Tchéquie 6 _ 6 2 juin 2022[109] 24 mai 2022[110]
  Thaïlande _ _ _ 30 mai 2022[111] 30 mai 2022[111]
  Trinité-et-Tobago _ _ _ 10 juin 2022 _
  Turquie 1 _ 1 30 juin 2022[112] 30 juin 2022[112]
  Ukraine _ _ _ 15 juin 2022 _
  Royaume-Uni 3055 _ 3055 18 aout 2022[48] 6 mai 2022[113]
  Etats-Unis 11915 _ 5189 18 aout 2022[48] 18 mai 2022[114],[115]
  Émirats arabes unis 13 _ 13 1 juin 2022[116] 24 mai 2022
  Uruguay _ 1 1 2 juin 2022[117] _
  Venezuela 1 _ 1 12 juin 2022[118] 12 juin 2022[118]
  Viêt Nam _ _ _ 7 juin 2022 _
  Saint-Vincent-et-les-Grenadines 2 _ 2 24 juli 2022 24 juli 2022
  Zambie _ 1 1 20 juin 2022 _
  Zimbabwe 2 _ 2 10 juli 2022 10 juli 2022
  Chine _ _ _ 14 juin 2022 14 juin 2022
  Jordanie _ _ _ 12 juin 2022 _
Total 37,736 97 4,251 12

Réactions et mesures

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Le , l'OMS tient une réunion d'urgence sur la propagation du virus[119].

L'agence européenne de santé, le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies, recommande l'isolement de tous les cas jusqu'à ce que les lésions provoquées par la maladie « soient complètement guéries »[24].

Le , la Belgique introduit une quarantaine obligatoire de 21 jours pour les personnes infectées[120].

Le Royaume-Uni appelle toutes les personnes à haut risque d'attraper la maladie, telles que celles habitant avec des personnes infectées ou le personnel de santé ayant été en contact avec des malades, à s'isoler pour une période de 21 jours[120].

L'agence onusienne ONUSIDA, se basant sur son expérience dans la lutte contre le Sida, condamne les propos homophobes et racistes survenant dans les commentaires au sujet de l'épidémie, affirmant que ces propos « minent la confiance et la capacité à répondre efficacement à des épidémies comme celle-ci »[121].

Aux États-Unis, le CDC alerte les hommes homosexuels et bisexuels sur le risque particulier de transmission du virus au sein de leur communauté à travers le monde, leur enjoignant de prendre des précautions s'ils ont été en contact avec des malades et de surveiller l'apparition de symptômes de la maladie, tout en rappelant que celle-ci peut toucher tout le monde[122].

Vaccination

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Le vaccin antivariolique de 3e génération MVA-BN (Modified Vaccinia Ankara de Bavarian Nordic (en) (IMVANEX en Europe, JYNNEOS aux États-Unis ou IMVAMUNE au Canada) est efficace contre la variole du singe. Il est administré par voie sous-cutanée. La primovaccination est de deux doses de 0,5 mL espacées d'au moins 28 jours. Les personnes vaccinées avec le vaccin de première génération n'auront que la dose de rappel[123].

En France, l'ANSM le recommande le dans le cadre d'une stratégie vaccinale réactive après exposition qu'elle doit être « administrée idéalement dans les 4 jours après le contact à risque et au maximum 14 jours plus tard » avec un rappel à 28 jours (deux pour personnes immunodéprimées)[123][réf. non conforme]. Le , la vaccination préventive est élargie aux personnes à risque[124][réf. non conforme]. Mardi , un centre de vaccination spécifique est ouvert en Île-de-France[125][réf. non conforme].

Génome

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Il existe dans le monde deux grands clades distincts du virus : celui du bassin du Congo (le plus virulent) et celui de l'Afrique de l'Ouest (moins agressif)[28].

La séquence génomique du virus associée à cette épidémie a été publiée pour la première fois le par des chercheurs portugais[126]. Ce virus appartenait au clade ouest-africain, déjà relié à d'autres épidémies internationales en 2018-2019[127], de même pour les autres échantillons séquencés (dont le premier cas aux États-Unis). Depuis, deux variants issus de la souche ouest-africaine ont été identifiés[128].

Le suivi des séquences génomiques lors d'émergences de ce type peut fournir plus d'informations sur « l'épidémiologie, les sources d'infection et les schémas de transmission »[126].

D'autres données et analyses sur le génome du virus sont attendues[127].

Notes et références

modifier
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  2. a et b (en) « Monkeypox - United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland » [archive du ], sur Organisation mondiale de la santé (consulté le ).
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  6. Le Progrès, « Variole du singe : plusieurs cas détectés en Angleterre, doit-on s'inquiéter ? ».
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  9. « Québec confirme deux cas de variole du singe, les premiers au Canada », sur Radio Canada, (consulté le ).
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Bibliographie

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