Chlamydiota

Cet article est une ébauche concernant la microbiologie.

Vous pouvez partager vos connaissances en l’améliorant (comment ?) selon les recommandations des projets correspondants.

Les Chlamydiota (en français les Chlamydiées) – anciennement Chlamydiae – sont un embranchement (ou phylum, ou encore division) du règne des Bacteria. Son nom provient de Chlamydia qui est le genre type de cet embranchement. Ces bactéries ont la particularité d'être toutes des parasites intracellulaires de cellules d'eucaryotes. Les espèces les plus connues infectent les mammifères (dont les humains) et les oiseaux, mais certaines ont été retrouvées chez d'autres hôtes, comme des amibes.

En 2022 selon la LPSN (30 novembre 2022)^[2] cet embranchement ne comporte qu'une seule classe, les Chlamydiia Horn 2016.

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de Chlamydiota est la suivante : Chla.my.di.o’ta N.L. fem. n. Chlamydia, genre type du phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Chlamydiota, le phylum des Chlamydia^[3]^,^[4].

Nomenclature

Ce taxon est décrit dès 2001 par G.M. Garrity et J.G Holt dans la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology sous le nom de « Chlamydiae »^[5]. Ce n'est qu'en 2021 qu'il est publié de manière valide par Oren et Garrity^[1] après un renommage conforme au code de nomenclature bactérienne (le nom de l'embranchement devant être dérivé de celui de son genre type, en l'occurrence Chlamydia, par adjonction du suffixe -ota conformément à une décision de l'ICSP en 2021^[6]).

Caractéristiques

Au départ, on les considérait comme un seul genre, Chlamydia, mais à l'heure actuelle, différents genres ont été reconnus. Ils sont apparentés à certains autres groupes bactériens, en particulier les Thermomicrobia, mais ils constituent un phylum à part.

Le cycle des Chlamydiota implique deux formes distinctes. Une infection se produit par des corps élémentaires, qui sont inactifs d'un point de vue métabolique. Ceux-ci sont absorbés dans une vacuole de la cellule, où ils grandissent pour devenir des corps réticulés, plus grands, qui se reproduiront. Plus tard de nouveaux corps élémentaires seront produits et expulsés de la cellule.

Les trois principales espèces de Chlamydiae infectant les humains sont :

Chlamydia trachomatis, qui provoque le trachome (une maladie ophtalmique) et la chlamydiose, une maladie sexuellement transmissible ;
Chlamydophila pneumoniae, qui provoque une forme de pneumonie ;
Chlamydophila psittaci, qui provoque la psittacose.

Notes et références

↑ ^{a et b} Oren A & Garrity GM « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes » Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(10):005056. Accès libre.
↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 30 novembre 2022
↑ Oren et Garrity 2021, p. 2.
↑ (en) « Phylum Chlamydiota », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le 11 novembre 2022)
↑ Garrity GM, Holt JG « The Road Map to the Manual » In : Boone DR, Castenholz RW, Garrity GM (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2ème édition, vol. 1 (The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria). Springer, New York, 2001. https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-0-387-21609-6_15
↑ Oren A et al. « Emendation of Rules 5b, 8, 15 and 22 of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes to include the rank of phylum » Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(6):004851. Accès libre.

Bibliographie

(en) D Corsaro et D Venditti, « Diversity of the parachlamydiae in the environment », Crit Rev Microbiol., vol. 32, n^o 4,‎ octobre 2006, p. 185-99
(en) A Oren et GM Garrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71, n^o 10,‎ 2021, p. 005056 (DOI 10.1099/ijsem.0.005056)

Liens externes

Phylum des Chlamydiae

(en) Référence Tree of Life Web Project : Chlamydiae
(en) Référence Catalogue of Life : Chlamydiae
(en) Référence NCBI : Chlamydiae (taxons inclus)

Classe des Chlamydiae

Sur les autres projets Wikimedia :

Chlamydiota, sur Wikimedia Commons

(en) Référence NCBI : Chlamydiae (class) (taxons inclus)

Ordre des Chlamydiales

(en) Référence Catalogue of Life : Chlamydiales Storz & Page, 1971 (consulté le 11 décembre 2020)
(fr + en) Référence ITIS : Chlamydiales
(en) Référence NCBI : Chlamydiales (taxons inclus)

Portail de la microbiologie

[Oren_2021-1] {a et b} Oren A & Garrity GM « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes » Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(10):005056. Accès libre.

[LPSN30_novembre_2022-2] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 30 novembre 2022

[OrenGarrity2021Oren20212-3] Oren et Garrity 2021, p. 2.

[LPSNV-4] (en) « Phylum Chlamydiota », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le 11 novembre 2022)

[5] Garrity GM, Holt JG « The Road Map to the Manual » In : Boone DR, Castenholz RW, Garrity GM (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2ème édition, vol. 1 (The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria). Springer, New York, 2001. https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-0-387-21609-6_15

[6] Oren A et al. « Emendation of Rules 5b, 8, 15 and 22 of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes to include the rank of phylum » Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(6):004851. Accès libre.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]