SHC014-CoV
SHC014-CoV est une souche de coronavirus lié au SRAS qui infecte les rhinolophes. Elle a été découverte dans la préfecture de Kunming, capitale du Yunnan, dans le sud de la Chine. Elle fut découverte en même temps que la souche Rs3367, dont la lignée capable d'infecter des cellules humaines fut appelée coronavirus de chauve-souris WIV1 lié au SRAS[2].
| Domaine | Riboviria |
|---|---|
| Ordre | Nidovirales |
| Sous-ordre | Cornidovirineae |
| Famille | Coronaviridae |
| Sous-famille | Orthocoronavirinae |
| Genre | Betacoronavirus |
| Sous-genre | Sarbecovirus |
| Espèce | SARSr-CoV |
- Espèce : SARSr-CoV
-
- SARS-CoV-1 (agent du SRAS)
-
- SARSr-CoV RaTG13
- SARS-CoV-2 (agent de la COVID-19)[1]
-
- Animal hôte :
- chauve-souris
- humain
Découverte
modifierD' à , dans la préfecture de Kunming, des chercheurs de l'Institut de virologie de Wuhan collectèrent des échantillons de matières fécales d'une colonie de chauve-souris de l'espèce Rhinolophus sinicus. Parmi les 117 échantillons, 27 (23 % du total) contenaient sept différentes souches de coronavirus liés au SRAS dont deux, nommées RsSHC014 et Rs3367, étaient inconnues[2].
Virologie
modifierEn 2013, des études ont montré que Rs3367 pouvait infecter des cellules humaines de la lignée HeLa. Cette lignée infectieuse a été baptisée coronavirus de chauve-souris WIV1 lié au SRAS[2].
En 2015, l'université de Caroline du Nord à Chapel Hill et l'Institut de virologie de Wuhan ont montré que SHC014 pouvait être modifié pour infecter des cellules HeLa en utilisant des procédés de génétique inverse pour créer un virus chimérique[3],[4].
La version SL-SHC014-MA15 du virus, conçue pour infecter les souris, diffère de 7 % (plus de 5 000 nucléotides) du SARS-CoV-2, le virus responsable de la pandémie de Covid-19[5].
Position phylogénétique
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SARS-CoV-2, 79 % / SARS-CoV-1[13] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
- Animal hôte :
- chauve-souris
- viverridé
- humain
Voir aussi
modifierRéférences
modifier- (en) Maciej F. Boni, Philippe Lemey, Xiaowei Jiang, Tommy Tsan-Yuk Lam, Blair W. Perry, Todd A. Castoe, Andrew Rambaut et David L. Robertson, « Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsible for the COVID-19 pandemic », Nature Microbiology, vol. 5, no 11, , p. 1408-1417 (PMID 32724171, DOI 10.1038/s41564-020-0771-4, lire en ligne)
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- Menachery VD, Yount BL, Debbink K, Agnihothram S, Gralinski LE, Plante JA, Graham RL, Scobey T, Ge XY, Donaldson EF, Randell SH, Lanzavecchia A, Marasco WA, Shi ZL, Baric RS, « A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence », Nature Medicine, vol. 21, no 12, , p. 1508–13 (PMID 26552008, PMCID 4797993, DOI 10.1038/nm.3985)
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- Xing‐Yi Ge, Ben Hu, and Zheng‐Li Shi, Bats and Viruses: A New Frontier of Emerging Infectious Diseases, First Edition., John Wiley & Sons, (lire en ligne), « BAT CORONAVIRUSES »
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