Nidovirales

Nidovirales je red virusa s životinjskim i ljudskim domaćinima. Red uključuje obitelji Coronaviridae,^[1]^[2] Arteriviridae,^[3]Roniviridae i Mesoniviridae.

Nidovirusi su jednolančani RNK virusi s pozitivnim osjećajem. Nazvani su latinskim Nidus, što znači gnijezdo, jer svi virusi ovog reda stvaraju 3 'ko-terminalni ugniježđen skup subgenomskih mRNK tijekom infekcije.

Virologija

Red Nidovirales sastoji se od virusa koji imaju jednolančane RNK genoma s pozitivnim osjećajem. Virusi pripadaju grupi IV baltimorskog klasifikacijskog sustava. Kao genomi pozitivnog smisla, virusi mogu koristiti neke proteinske stanice domaćina tijekom replikacije i ekspresije gena koji se događaju u citoplazmi stanice domaćina.

Genom

Ovaj redoslijed virusa može se razlikovati od ostalih RNK virusa po konstalaciji sedam sačuvanih domena - 5'-TM2-3CLpro-TM3-RdRp-Zm-HEL1-NendoU-3'- pri čemu su prva tri kodirana u ORF1a, a preostali četiri u ORF1b. TM2 i TM3 i transmembranske domene; RdRp je RNA polimeraza; Zm je domena vezanja Zn-klastera pripojena helikazom (HEL1); 3CLpro je 3C slična proteaza; a NendoU je endridukleaza specifična za uridilat. 3CLpro ima katalitičku dijagnozu His-Cys, a koristi se i kao glavna proteinaza koronavirusa SARS-a.

Taksonomija

Poredak Nidovirales može se podijeliti u dva sloja, ovisno o veličini genoma: oni s velikim genima (26,3–31,7 kilobaza) koji uključuju Coronaviridae i Roniviridae (veliki nidovirusi) i oni s malim genomima (mali nidovirusi) -a klada koja uključuje udaljeno srodne Arteriviridae (12,7–15,7 kb). Veliki nidovirusi kodiraju i 2'-O-metiltransferazu i 3'-5 'eksoribonukleazu (ExoN) - potonji su vrlo neuobičajeni za RNK virus. Oni također kodiraju superamiljenu 1 helikazu, specifičnu za uridilat endonukleazu (enzim jedinstven za nidoviruse) i nekoliko proteaza.

Vidi još

Izvori

↑ Enjuanes, Luis; Sola, Isabel; Zúñiga, Sonia; Almazán, Fernando. 2008. Coronavirus Replication and Interaction with Host. Mettenleiter, Thomas C.; Sobrino, Francisco (ur.). Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6
↑ Volker Thiel, ur. 2007. Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-16-5
↑ Balasuriya, Udeni; Snijder, Eric J. 2008. Arteriviruses. Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino (ur.). Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6

[sobrino4-1] Enjuanes, Luis; Sola, Isabel; Zúñiga, Sonia; Almazán, Fernando. 2008. Coronavirus Replication and Interaction with Host. Mettenleiter, Thomas C.; Sobrino, Francisco (ur.). Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6

[Thiel-2] Volker Thiel, ur. 2007. Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-16-5

[sobrino3-3] Balasuriya, Udeni; Snijder, Eric J. 2008. Arteriviruses. Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino (ur.). Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6

[1]

[2]

[3]