Kofaktor (biokimia)
Sebuah kofaktor adalah senyawa kimia non-protein yang diperlukan untuk aktivitas biologis protein. Protein ini biasanya enzim, dan kofaktor dapat dianggap "molekul pembantu" yang membantu dalam transformasi biokimia.
Kofaktor dapat dibagi lagi menjadi salah satu atau lebih ion anorganik, atau molekul organik atau metalloorganic kompleks yang disebut koenzim;[1] yang sebagian besar berasal dari vitamin dan dari nutrien organik yang dibutuhkan dalam jumlah kecil. Sebuah kofaktor yang terikat erat atau bahkan terikat secara kovalen disebut gugus prostetik.[2] Selain itu, beberapa sumber juga membatasi penggunaan istilah "kofaktor" untuk bahan anorganik.[3][4] Sebuah enzim yang tidak aktif tanpa kofaktor disebut sebuah apoenzim, sedangkan enzim lengkap dengan kofaktor disebut holoenzim.[5]
Beberapa enzim atau kompleks enzim memerlukan beberapa kofaktor. Sebagai contoh, kompleks multienzim piruvat dehidrogenase[6] pada persimpangan glikolisis dan siklus asam sitrat membutuhkan lima kofaktor organik dan satu ion logam: tiamina pirofosfat (TPP) yang terikat lemah, lipoamida dan flavin adenina dinukleotida (FAD) yang terikat secara kovalen, dan kosubstrat nikotinamida adenina dinukleotida (NAD+) dan koenzim A (CoA), serta sebuah ion logam (Mg2+).[7]
Klasifikasi
suntingKofaktor dapat dibagi menjadi dua kelompok utama: Kofaktor organik, seperti flavin atau heme, dan kofaktor anorganik, seperti ion logam Mg2+, Cu+, Mn2+, atau kluster besi-sulfur.
Kofaktor organik kadang dibagi lagi menjadi koenzim dan gugus prostetik. Istilah koenzim mengacu secara spesifik pada enzim dan, dengan demikian, sifat fungsional protein. Di sisi lain, gugus prostetik menekankan sifat pengikatan kofaktor ke protein (ketat atau kovalen) dan, dengan demikian, mengacu pada sifat struktural. Sumber yang berbeda memberi definisi koenzim, kofaktor, dan gugus prostetik yang sedikit berbeda. Beberapa mempertimbangkan molekul organik terikat ketat sebagai gugus prostetik dan bukan sebagai koenzim, sementara yang lain mendefinisikan semua molekul organik non-protein yang dibutuhkan untuk aktivitas enzim sebagai koenzim, dan mengklasifikasikannya yang terikat ketat sebagai gugus prostetik koenzim. Istilah ini sering digunakan secara longgar.
Suatu surat tahun 1980 dalam Trends in Biochemistry Sciences mencatat kebingungan dalam literatur dan perbedaan yang sewenang-wenang sewenang-wenang antara kelompok prostetik dan kelompok koenzim dan mengusulkan skema berikut. Di sini, kofaktor didefinisikan sebagai zat tambahan selain protein dan substrat yang diperlukan untuk aktivitas enzim dan kelompok prostetik sebagai zat yang menjalani seluruh siklus katalitik yang melekat pada satu molekul enzim tunggal. Namun, penulis tidak dapat sampai pada satu definisi menyeluruh tentang "koenzim" dan mengusulkan bahwa istilah ini dikeluarkan dari penggunaan dalam literatur.[8]
Lihat pula
sunting
Referensi
sunting- ^ Hasim, Onn (2010). Coenzyme, Cofactor and Prosthetic Group - Ambiguous Biochemical Jargon. Kuala Lumpur: Biochemical Education. hlm. 93–94.
- ^ Nelson, David (2008). <Lehninger Principles of Biochemistry>. New York: W.H. Freeman and Company. hlm. 184.
- ^ "coenzymes and cofactors". Diakses tanggal 17 November 2007.
- ^ "Enzyme Cofactors". Diakses tanggal 17 November 2007.
- ^ Sauke, David J.; Metzler, David E.; Metzler, Carol M. (2001). Biochemistry: the chemical reactions of living cells (edisi ke-2nd). San Diego: Harcourt/Academic Press. ISBN 0-12-492540-5.
- ^ Jordan F, Patel MS (2004). Thiamine: catalytic mechanisms in normal and disease states. New York, N.Y: Marcel Dekker. hlm. 588. ISBN 0-8247-4062-9.
- ^ "Pyruvate Dehydrogenase Complex". Chemistry LibreTexts. 2 Oktober 2013. Diakses tanggal 10 Mei 2017.
- ^ Bryce CFA (March 1979). "SAM – semantics and misunderstandings". Trends Biochem. Sci. 4 (3): N62. doi:10.1016/0968-0004(79)90255-X.
Bacaan lebih lanjut
sunting- Bugg T (1997). An introduction to enzyme and coenzyme chemistry. Oxford: Blackwell Science. ISBN 0-86542-793-3.
Pranala luar
sunting- Materi kuliah kofaktor Diarsipkan 2016-10-05 di Wayback Machine. (berkas Powerpoint)
- MeSH Enzyme+cofactors
- The CoFactor Database