Erano iscritte tutte le formazioni partecipanti alla Vysšaja Liga 1989. Le 16 squadre furono divise in quattro gironi da quattro squadre: in ciascun girone si disputavano gare di andata e ritorno per un totale di sei incontri per squadra, assegnando due punti per la vittoria, uno per il pareggio e zero per la sconfitta. Erano ammesse al secondo turno le prime due di ciascun girone.
Le quattro vincitrici dei quattro gironi disputavano i quarti in casa contro le quattro seconde classificate; quarti e semifinali erano giocate su gare di sola andata, così, come la finale, disputata però in campo neutro.
- Ammesse alla seconda fase: Dnepr e Rotor
| 1ª giornata
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26 febbraio 1989
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| Ararat-Rotor |
3-0[1]
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| Zenit Leningrado-Dnepr |
1-2
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| 2ª giornata
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4/5 marzo 1989
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| Rotor-Zenit Leningrado |
2-1
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| Dnepr-Ararat |
2-0
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| 3ª giornata
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21/22 marzo 1989
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| Zenit Leningrado-Ararat |
3-1
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| Dnepr-Rotor |
2-1
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| 4ª giornata
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23 aprile 1989
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| Dnepr-Zenit Leningrado |
1-0
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| Rotor-Ararat |
5-0
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| 5ª giornata
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7 maggio 1989
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| Rotor-Dnepr |
1-0
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| Ararat-Zenit Leningrado |
2-1
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| 6ª giornata
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29 maggio 1989
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| Ararat-Dnepr |
1-0
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| Zenit Leningrado-Rotor |
0-0
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- Ammesse alla seconda fase: Dinamo Mosca e Torpedo Mosca
| 1ª giornata
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26 febbraio 1989
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| Dinamo Mosca-Lokomotiv Mosca |
3-1
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| Spartak Mosca-Torpedo Mosca |
1-2
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| 2ª giornata
|
4/5 marzo 1989
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| Lokomotiv Mosca-Torpedo Mosca |
0-2
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| Dinamo Mosca-Spartak Mosca |
0-1
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| 3ª giornata
|
21/22 marzo 1989
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| Lokomotiv Mosca-Spartak Mosca |
2-1
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| Torpedo Mosca-Dinamo Mosca |
1-2
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| 4ª giornata
|
23/24 aprile 1989
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| Torpedo Mosca-Spartak Mosca |
3-0
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| Lokomotiv Mosca-Dinamo Mosca |
2-3
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| 5ª giornata
|
7/8 maggio 1989
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| Torpedo Mosca-Lokomotiv Mosca |
4-1
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| Spartak Mosca-Dinamo Mosca |
2-2
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| 6ª giornata
|
29/30 maggio 1989
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| Lokomotiv Mosca-Spartak Mosca |
1-2
|
| Dinamo Mosca-Torpedo Mosca |
4-1
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- Ammesse alla seconda fase: Šachtar e Čornomorec'
| 1ª giornata
|
26 febbraio 1989
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| Čornomorec'-Šachtar |
0-2
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| Metalist-Dinamo Kiev |
0-0
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| 2ª giornata
|
4/5 marzo 1989
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| Dinamo Kiev-Čornomorec' |
0-0
|
| Metalist-Šachtar |
1-2
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| 3ª giornata
|
21 /22 marzo 1989
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| Dinamo Kiev-Šachtar |
1-1
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| Čornomorec'-Metalist |
4-0
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| 4ª giornata
|
23 aprile 1989
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| Čornomorec'-Dinamo Kiev |
3-0
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| Šachtar-Metalist |
6-0
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| 5ª giornata
|
7 maggio 1989
|
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| Dinamo Kiev-Metalist |
0-1
|
| Šachtar-Čornomorec' |
1-0
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| 6ª giornata
|
29 maggio 1989
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| Metalist-Čornomorec' |
0-1
|
| Šachtar-Dinamo Kiev |
1-0
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- Ammesse alla seconda fase: Dinamo Minsk e Pamir Dušanbe
| 1ª giornata
|
26 febbraio 1989
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| Pamir Dušanbe-Dinamo Minsk |
2-2
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| Žalgiris Vilnius-Dinamo Tbilisi |
3-0
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| 2ª giornata
|
3/4 marzo 1989
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| Dinamo Tbilisi-Dinamo Minsk |
0-1
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| Pamir Dušanbe-Žalgiris Vilnius |
3-0
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| 3ª giornata
|
22 marzo 1989
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| Dinamo Tbilisi-Pamir Dušanbe |
1-0
|
| Dinamo Minsk-Žalgiris Vilnius |
4-2
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| 4ª giornata
|
23 aprile 1989
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| Pamir Dušanbe-Dinamo Tbilisi |
1-0
|
| Žalgiris Vilnius-Dinamo Minsk |
1-3
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| 5ª giornata
|
7/8 maggio 1989
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| Dinamo Tbilisi-Žalgiris Vilnius |
1-0
|
| Dinamo Minsk-Pamir Dušanbe |
1-0
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| 6ª giornata
|
29/30 maggio 1989
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| Dinamo Minsk-Dinamo Tbilisi |
3-0
|
| Žalgiris Vilnius-Pamir Dušanbe |
3-0
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Partite disputate il 4 e 5 settembre 1989.
Partite disputate il 6 ottobre 1989.
Calcio
Unione Sovietica
Dnepr
Dinamo Minsk
Dinamo Mosca
Šachtar
Rotor
Ararat
Zenit Leningrado
Torpedo Mosca
Spartak Mosca
Lokomotiv Mosca
Čornomorec'
Metalist
Dinamo Kiev
CSKA Pamir
Žalgiris
Dinamo Tbilisi