DrugBank

DrugBank

Tip de afacere	bază de date farmaceutică
Proprietar(i)	University of Alberta and The Metabolomics Innovation Centre
URL	www.drugbank.ca
Comercial	nu
Lansat	2006^[1]

DrugBank este o bază de date ce conține informații legate de medicamente.^[1] Este o sursă bioinformatică și chemoinformatică, oferind informații detaliate (de ordin chimic, farmacologic și farmaceutic) în legătură cu medicamentele disponibile pe piață (pentru uz uman și veterinar), cât și cu cele retrase de pe piață. În plus, baza de date oferă și structurile chimice corespunzătoare.^[1]^[2] Instituția care se ocupă de baza de date este University of Alberta and The Metabolomics Innovation Centre din Alberta, Canada.

Ultima versiune a bazei de date (versiunea 5.0) conține informații despre 9591 medicamente, dintre care 2037 sunt molecule mici aprobate de către FDA, 241 medicamente biologice aprobate de către FDA (proteine/peptide), 96 sunt nutraceutice și peste 6000 sunt medicamente experimentale.^[3]

Patru baze de date suplimentare, HMDB,^[4] T3DB,^[5] SMPDB^[6] și FooDB fac parte, de asemenea, dintr-o suită generală de baze de date metabolomice/cheminformatice. HMDB conține informații echivalente despre peste 40 000 de metaboliți umani, T3DB conține informații despre 3100 de toxine comune și poluanți de mediu, SMPDB conține diagrame de căi pentru aproape 700 de căi metabolice umane și căi de boală, în timp ce FooDB conține informații echivalente despre ~28 000 de componente alimentare și aditivi alimentari.

Note

^ ^a ^b ^c Wishart, DS; Knox C; Guo AC; et al. (2006). „DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration”. Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D668-D672. doi:10.1093/nar/gkj067. PMC 1347430  . PMID 16381955.
^ Wishart, DS; Knox C; Guo AC; et al. (2008). „DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug _targets”. Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D901–906. doi:10.1093/nar/gkm958. PMC 2238889  . PMID 18048412.
^ Law, V; Knox, C; Djoumbou, Y; Jewison, T; Guo, AC; Liu, Y; Maciejewski, A; Arndt, D; Wilson, M; Neveu, V; Tang, A; Gabriel, G; Ly, C; Adamjee, S; Dame, ZT; Han, B; Zhou, Y; Wishart, DS (2014). „DrugBank 5.0: shedding new light on drug metabolism”. Nucleic Acids Research. 42 (Database issue): D1091-7. doi:10.1093/nar/gkt1068. PMC 3965102  . PMID 24203711.
^ Wishart, DS; Guo, AC; Eisner, R; Young, N; Gautam, B; Hau, DD; Psychogios, N; Dong, E; Bouatra, S; Mandal, R; Sinelnikov, I; Xia, J; Jia, L; Cruz, JA; Lim, E; Sobsey, CA; Shrivastava, S; Huang, P; Liu, P; Fang, L; Peng, J; Fradette, R; Cheng, D; Tzur, D; Clements, M; Lewis, A; De Souza, A; Zuniga, A; Dawe, M; Xiong, Y; Clive, D; Greiner, R; Nazyrova, A; Shaykhutdinov, R; Li, L; Vogel, HJ; Forsythe, I (2009). „HMDB: a knowledgebase for the human metabolome”. Nucleic Acids Research. 37 (Database issue): D603–10. doi:10.1093/nar/gkn810. PMC 2686599  . PMID 18953024.
^ Lim, E; Pon A; Djoumbou Y; Knox C; Shrivastava S; Guo AC; Neveu V; Wishart DS. (2010). „T3DB: a comprehensively annotated database of common toxins and their _targets”. Nucleic Acids Research. 38 (Database issue): D781–6. doi:10.1093/nar/gkp934. PMC 2808899  . PMID 19897546.
^ Jewison, T; Su Y; Disfany FM; et al. (2014). „Small Molecule Pathway Database”. Nucleic Acids Research. 42 (Database issue): D478–84. doi:10.1093/nar/gkt1067. PMC 3965088  . PMID 24203708.

Vezi și

Wikidata are proprietatea:

DrugBank ID (P715) (vezi utilizări)

[pmid16381955-1] Wishart, DS; Knox C; Guo AC; et al. (2006). „DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration”. Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D668-D672. doi:10.1093/nar/gkj067. PMC 1347430  . PMID 16381955.

[pmid18048412-2] Wishart, DS; Knox C; Guo AC; et al. (2008). „DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug _targets”. Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D901–906. doi:10.1093/nar/gkm958. PMC 2238889  . PMID 18048412.

[pmid24203711-3] Law, V; Knox, C; Djoumbou, Y; Jewison, T; Guo, AC; Liu, Y; Maciejewski, A; Arndt, D; Wilson, M; Neveu, V; Tang, A; Gabriel, G; Ly, C; Adamjee, S; Dame, ZT; Han, B; Zhou, Y; Wishart, DS (2014). „DrugBank 5.0: shedding new light on drug metabolism”. Nucleic Acids Research. 42 (Database issue): D1091-7. doi:10.1093/nar/gkt1068. PMC 3965102  . PMID 24203711.

[pmid18953024-4] Wishart, DS; Guo, AC; Eisner, R; Young, N; Gautam, B; Hau, DD; Psychogios, N; Dong, E; Bouatra, S; Mandal, R; Sinelnikov, I; Xia, J; Jia, L; Cruz, JA; Lim, E; Sobsey, CA; Shrivastava, S; Huang, P; Liu, P; Fang, L; Peng, J; Fradette, R; Cheng, D; Tzur, D; Clements, M; Lewis, A; De Souza, A; Zuniga, A; Dawe, M; Xiong, Y; Clive, D; Greiner, R; Nazyrova, A; Shaykhutdinov, R; Li, L; Vogel, HJ; Forsythe, I (2009). „HMDB: a knowledgebase for the human metabolome”. Nucleic Acids Research. 37 (Database issue): D603–10. doi:10.1093/nar/gkn810. PMC 2686599  . PMID 18953024.

[pmid19897546-5] Lim, E; Pon A; Djoumbou Y; Knox C; Shrivastava S; Guo AC; Neveu V; Wishart DS. (2010). „T3DB: a comprehensively annotated database of common toxins and their _targets”. Nucleic Acids Research. 38 (Database issue): D781–6. doi:10.1093/nar/gkp934. PMC 2808899  . PMID 19897546.

[pmid24203708-6] Jewison, T; Su Y; Disfany FM; et al. (2014). „Small Molecule Pathway Database”. Nucleic Acids Research. 42 (Database issue): D478–84. doi:10.1093/nar/gkt1067. PMC 3965088  . PMID 24203708.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]