Штамм (от нем. Stamm, дословно — «ствол; род») — чистая культура бактерий, грибов, и иных микроорганизмов, а также вирусов и прионов[1], выделенная из определённого источника и идентифицированная по тестам современной классификации. Поскольку многие микроорганизмы размножаются бинарным делением (простое деление клетки, свойственное бактериям) или митозом (эукариотические микроорганизмы, такие, как грибы, водоросли), без участия полового процесса, по существу, виды у таких микроорганизмов состоят из клональных линий, генетически и морфологически идентичных исходной клетке. Штамм не является таксономической категорией, один и тот же штамм не может быть выделен второй раз из того же источника в другое время[2].

Колонии штамма бактерий Yersinia на поверхности агар-агара

Отнесение микроорганизма к определённому виду происходит на основе достаточно широких признаков, например, по чувствительности к антибиотикам, способности к образованию токсинов, ферментов, способности расти на определённых питательных средах и др. Внутри вида существуют вариации относительно размера и формы колоний микроорганизма, уровню продукции ферментов, наличию плазмид, вирулентности и т. п.

В мире не существует общепризнанной номенклатуры названия штаммов, и используемые названия достаточно произвольны. Как правило, они состоят из отдельных букв и цифр, которые записываются после видового названия. Например, один из самых известных штаммов кишечной палочки — E. coli K-12.

Штаммы в вирусологии

править

В сообществе вирусологов отсутствует общепринятое определение терминов «штамм», «вариант» и «изолят»[3]. По одному из определений, «штаммы — вирусы, относящиеся к одному виду и отличающиеся стабильными и наследуемыми биологическими, серологическими и/или молекулярными характеристиками»[4]. Под штаммами также могут пониматься проба живого инфекционного агента, взятая у одного пациента. Генотип вируса определяется границами генетического различия ветви штаммов (5-10%).

См. также

править

Примечания

править
  1. Jason C. Bartz. Prion Strain Diversity // Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine. — 2016-12. — Т. 6, вып. 12. — С. a024349. — ISSN 2157-1422. — doi:10.1101/cshperspect.a024349. Архивировано 27 марта 2023 года.
  2. Л. Б. Борисов, И. С. Фрейдлин. Краткий справочник микробиологической терминологии. — М.: «Медицина», 1975. — 136 с. — 15 000 экз. Архивировано 23 мая 2009 года. Архивированная копия. Дата обращения: 3 сентября 2009. Архивировано 23 мая 2009 года.
  3. Kuhn J. H. et al. Virus nomenclature below the species level: a standardized nomenclature for natural variants of viruses assigned to the family Filoviridae (англ.) // Archives of Virology. — 2012. — Vol. 158, no. 1. — P. 301—311. — ISSN 0304-8608. — doi:10.1007/s00705-012-1454-0. [исправить]
  4. Fauquet C. M., Stanley J. Revising the way we conceive and name viruses below the species level: A review of geminivirus taxonomy calls for new standardized isolate descriptors (англ.) // Archives of Virology. — 2005. — Vol. 150, no. 10. — P. 2151—2179. — ISSN 0304-8608. — doi:10.1007/s00705-005-0583-0. [исправить]

Литература

править
  NODES