Трепонемы
Трепонемы[2] (лат. Treponema) — род извитых бактерий из семейства Spirochaetaceae порядка спирохет (Spirochaetales)[3].
| Трепонемы | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | ||||||||||
| Научная классификация | ||||||||||
|
Домен: Тип: Spirochaetae Cavalier-Smith 2002 Класс: Spirochaetes Cavalier-Smith 2002 Порядок: Семейство: Род: Трепонемы |
||||||||||
| Международное научное название | ||||||||||
| Treponema (Schaudinn 1905) Abt, Göker and Klenk 2013[1] | ||||||||||
| Синонимы | ||||||||||
| ||||||||||
Патогенность
правитьВозбудители трепонематозов человека[4][5]:
| Подвид или вид бактерий | Болезнь | Географическое распространение | Возраст заболевших | Путь заражения | Врождённые формы |
|---|---|---|---|---|---|
| Treponema pallidum subsp. pallidum | Сифилис | Повсеместно | Взрослые, подростки | Половой | Да |
| Treponema pallidum subsp. carateum | Пинта | Полупустыни с теплым климатом: Северная Америка | Дети, подростки | Контакт с кожей | Нет |
| Treponema pallidum subsp. endemicum | Беджель | Пустыни: Северная Африка, Ближний восток | Дети, подростки, взрослые | Контакт со слизистыми | Редко |
| Treponema pertenue | Фрамбезия | Тропики: Африка, Индонезия, Карибский бассейн | Дети | Контакт с кожей | Нет |
Филогения
правитьНа основе анализа 16s-рибосомной субъединицы РНК в проекте LTP (выпуск 123) построено филогенетическое дерево всех видов[7].
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Таксономия
правитьВ настоящее время принята классификация на основе номенклатуры названий прокариотов (LPSN)[8] и Национального центра биотехнологической информации (NBCI)[9]:
- ?Candidatus Treponema suis Molbak et al. 2006
- ?Treponema calligyrum ♠ Noguchi
- ?Treponema carateum ♥ (pinta causing Treponema)
- ?Treponema minutum ♦ Dobell 1912
- ?Treponema pallidum ♦ (Schaudinn and Hoffmann 1905) Schaudinn 1905
- ?Treponema paraluisleporis ♠ Lumeij et al. 1994
- ?Treponema paraluiscuniculi ♦ (Jacobsthal 1920) Smibert 1974
- ?Treponema pertenue ♦ (Castellani 1905) Castellani & Chalmers 1910
- ?Treponema phagedenis ♠
- T. p. phagedenis ♠ (Noguchi 1912) Brumpt
- T. p. vaccae ♠ Evans et al. 2006
- ?Treponema refringens ♠ (Schaudinn and Hofmann 1905) Castellani and Chalmers
- ?Treponema vincentii ♠ Smibert 1984
- ?Treponema zioleckii ♠ Piknova et al. 2008
- Treponema amylovorum Wyss et al. 1997
- Treponema azotonutricium Graber et al. 2004
- Treponema berlinense Nordhoff et al. 2005
- Treponema brennaborense Schrank et al. 1999
- Treponema bryantii Stanton and Canale-Parola 1980
- Treponema caldarium (Pohlschroeder et al. 1995) Abt, Göker & Klenk 2013
- Treponema denticola (ex Flügge 1886) Chan et al. 1993
- Treponema isoptericolens Dröge et al. 2008
- Treponema lecithinolyticum Wyss et al. 1999
- Treponema maltophilum Wyss et al. 1996
- Treponema medium ♦ Umemoto et al. 1997
- T. m. bovis ♠ Evans et al. 2006
- T. m. medium ♠ Umemoto et al. 1997
- Treponema parvum Wyss et al. 2001
- Treponema pectinovorum Smibert and Burmeister 1983
- Treponema pedis Evans et al. 2009
- Treponema porcinum Nordhoff et al. 2005
- Treponema primitia Graber et al. 2004
- Treponema putidum Wyss et al. 2004
- Treponema saccharophilum Paster and Canale-Parola 1986
- Treponema socranskii Smibert et al. 1984
- T. s. paredis Smibert et al. 1984
- T. s. buccale Smibert et al. 1984
- T. s. socranskii Smibert et al. 1984
- Treponema stenostreptum (Zuelzer 1912) Abt, Göker & Klenk 2013
- Treponema succinifaciens Cwyk and Canale-Parola 1981
- Treponema zuelzerae (ex Veldkamp 1960) Canale-Parola 1980 emend. Abt, Göker & Klenk 2013
Примечания:
- ♦ Типовой штамм утерян или недоступен
- ♠ Штамм есть в NCBI, но отсутствует в LSPN
- ♥ Штамм не направлен в NCBI, но есть в списке LPSN
Примечания
править- ↑ 1 2 3 Genus Treponema : [англ.] // LPSN. (Дата обращения: 17 сентября 2017).
- ↑ Атлас по медицинской микробиологии, вирусологии и иммунологии : Учебное пособие для студентов медицинских вузов / Под ред. А. А. Воробьева, А. С. Быкова. — М. : Медицинское информационное агентство, 2003. — С. 78. — 236 с. — ISBN 5-89481-136-8.
- ↑ Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria) : Version 2.0 : [англ.] // LPSN. — 2016. — 2 October.
- ↑ Медицинская и санитарная микробиология / А. А. Воробьев, Ю. С. Кривошеин, В. П. Широбоков. — М.: Академия, 2003. — С. 52. — ISBN 5-7695-1292-X.
- ↑ The endemic treponematoses (неопр.) // Microbes Infect.. — 2002. — January (т. 4, № 1). — С. 83—94. — doi:10.1016/S1286-4579(01)01513-1. — PMID 11825779. Архивировано 19 сентября 2019 года.
- ↑ The sequence of the acidic repeat protein (arp) gene differentiates venereal from nonvenereal Treponema pallidum subspecies, and the gene has evolved under strong positive selection in the subspecies that causes syphilis (англ.) // FEMS Immunol. Med. Microbiol. : journal. — 2008. — August (vol. 53, no. 3). — P. 322—332. — doi:10.1111/j.1574-695X.2008.00427.x. — PMID 18554302. Архивировано 5 января 2013 года.
- ↑ 'The All-Species Living Tree' Project.16S rRNA-based LTP release 123 (full tree). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Дата обращения: 20 марта 2013. Архивировано 7 июня 2019 года.
- ↑ J.P. Euzéby Treponema. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Дата обращения: 20 марта 2016. Архивировано 4 августа 2020 года.
- ↑ Sayers Treponema. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Дата обращения: 20 марта 2016. Архивировано 24 октября 2017 года.