Reverzna transkriptaza
U molekularnoj biologiji i biohemiji, reverzna transkriptaza (RNK zavisna DNK polimeraza) je DNK polimerazni enzim koji transkribuje jednolančanu RNK u jednolančanu DNK. Ona je isto tako DNK zavisna DNK polimeraza koja sintetiše drugi lanac DNK komplementaran sa reverzno transkribovanom jednolačanom cDNK nakon degradacije originalne iRNK. Ovaj enzim se naziva reverznim zato što normalna transkripcija obuhvata sintezu RNK iz DNK.
| |||||||||
| Kristalografska struktura HIV reverzne transkriptaze.[1] | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | RVT_1 | ||||||||
| Pfam | PF00078 | ||||||||
| Pfam klan | CL0027 | ||||||||
| InterPro | IPR000477 | ||||||||
| PROSITE | PS50878 | ||||||||
| SCOP | 1hmv | ||||||||
| Superfamilija | 1hmv | ||||||||
| CDD | cd00304 | ||||||||
| |||||||||
| RNK usmerena DNK polimeraza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||
| EC broj | 2.7.7.49 | ||||||||
| CAS broj | 9068-38-6 | ||||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||||
| MetaCyc | metabolic pathway | ||||||||
| PRIAM | profile | ||||||||
| PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum | ||||||||
| Ontologija gena | AmiGO / EGO | ||||||||
| |||||||||
Dobro izučene reverzne transkriptaze su:
- HIV-1 reverzna transkriptaza iz HIV tipa 1 (PDB 1HMV)
- M-MLV reverzna transkriptaza iz virusa leukemije glodara
- AMV reverzna transkriptaza iz alfaretrovirusa
- Telomerazna reverzna transkriptaza koja održava telomere eukariotskih hromozoma.
Reference
uredi- ↑ PDB 3KLF; Tu X, Das K, Han Q, Bauman JD, Clark AD Jr, Hou X, Frenkel YV, Gaffney BL, Jones RA, Boyer PL, Hughes SH, Sarafianos SG, Arnold E (September 2010). „Structural basis of HIV-1 resistance to AZT by excision.”. Nat. Struct. Mol. Biol. 17 (10): 1202–9. DOI:10.1038/nsmb.1908. PMC 2987654. PMID 20852643.
Literatura
uredi- Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
- Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
- Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0.
- Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
- Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X.
- Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842.