Тромбін

Тромбін
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A2C, 1A3B, 1A3E, 1ABI, 1ABJ, 1AD8, 1AE8, 1AI8, 1AIX, 1AWF, 1AWH, 1AY6, 1B5G, 1B7X, 1BA8, 1BB0, 1BCU, 1BHX, 1BMM, 1BMN, 1BTH, 1C1U, 1C1V, 1C1W, 1C4U, 1C4V, 1C4Y, 1C5L, 1C5N, 1C5O, 1CA8, 1D3D, 1D3P, 1D3Q, 1D3T, 1D4P, 1D6W, 1D9I, 1DE7, 1DIT, 1DM4, 1DOJ, 1DWB, 1DWC, 1DWD, 1DX5, 1E0F, 1EB1, 1EOJ, 1EOL, 1FPC, 1G30, 1G32, 1G37, 1GHV, 1GHW, 1GHX, 1GHY, 1GJ4, 1GJ5, 1H8D, 1H8I, 1HAI, 1HAO, 1HAP, 1HBT, 1HLT, 1HUT, 1HXE, 1HXF, 1IHS, 1JMO, 1JOU, 1JWT, 1K21, 1K22, 1KTS, 1KTT, 1LHC, 1LHD, 1LHE, 1LHF, 1LHG, 1MH0, 1MU6, 1MU8, 1MUE, 1NM6, 1NRN, 1NRO, 1NRP, 1NRQ, 1NRR, 1NRS, 1NT1, 1NU7, 1NU9, 1NY2, 1NZQ, 1O0D, 1O2G, 1O5G, 1OOK, 1OYT, 1P8V, 1PPB, 1QBV, 1QHR, 1QJ1, 1QJ6, 1QJ7, 1QUR, 1RD3, 1RIW, 1SB1, 1SFQ, 1SG8, 1SGI, 1SHH, 1SL3, 1SR5, 1T4U, 1T4V, 1TA2, 1TA6, 1TB6, 1THP, 1THR, 1THS, 1TMB, 1TMU, 1TOM, 1TQ0, 1TQ7, 1TWX, 1UVS, 1VR1, 1VZQ, 1W7G, 1WAY, 1WBG, 1XM1, 1XMN, 1YPE, 1YPG, 1YPJ, 1YPK, 1YPL, 1YPM, 1Z71, 1Z8I, 1Z8J, 1ZGI, 1ZGV, 1ZRB, 2A0Q, 2A2X, 2A45, 2AFQ, 2ANK, 2ANM, 2B5T, 2BDY, 2BVR, 2BVS, 2BVX, 2BXT, 2BXU, 2C8Y, 2FEQ, 2FES, 2GDE, 2GP9, 2H9T, 2HGT, 2HNT, 2HPP, 2HPQ, 2HWL, 2JH0, 2JH6, 2OD3, 2PGB, 2PGQ, 2PW8, 2R2M, 2THF, 2ZFQ, 2ZFR, 2ZG0, 2ZHE, 2ZHF, 2ZHW, 2ZI2, 2ZIQ, 2ZNK, 2ZO3, 3B23, 3B9F, 3BEF, 3BEI, 3BF6, 3BIU, 3BIV, 3BV9, 3C1K, 3C27, 3D49, 3DA9, 3DD2, 3DT0, 3DUX, 3E6P, 3EE0, 3EQ0, 3F68, 3GIC, 3GIS, 3HAT, 3HKJ, 3HTC, 3JZ2, 3LDX, 3LU9, 3NXP, 3P17, 3P6Z, 3P70, 3PO1, 3QGN, 3QLP, 3QTO, 3QTV, 3QWC, 3QX5, 3R3G, 3RLW, 3RLY, 3RM0, 3RM2, 3RML, 3RMM, 3RMN, 3RMO, 3S7H, 3S7K, 3SHA, 3SHC, 3SI3, 3SI4, 3SQE, 3SQH, 3SV2, 3T5F, 3TU7, 3U69, 3U8O, 3U8R, 3U8T, 3U98, 3U9A, 3UTU, 3UWJ, 3VXE, 3VXF, 4BAH, 4BAK, 4BAM, 4BAN, 4BAO, 4BAQ, 4BOH, 4DIH, 4DII, 4DT7, 4DY7, 4E05, 4E06, 4E7R, 4H6S, 4H6T, 4HFP, 4HTC, 4THN, 5GDS, 7KME, 8KME, 1A46, 1A4W, 1A5G, 1A61, 1AFE, 1AHT, 1DWE, 1FPH, 1HAG, 1HAH, 1HDT, 1HGT, 1IHT, 1NO9, 1TBZ, 1TMT, 1UMA, 2C8W, 2C8X, 2C8Z, 2C90, 2C93, 2CF8, 2CF9, 2CN0, 2JH5, 2PKS, 2UUF, 2UUJ, 2UUK, 2V3H, 2V3O, 2ZC9, 2ZDA, 2ZDV, 2ZF0, 2ZFF, 2ZFP, 2ZGB, 2ZGX, 2ZHQ, 3DHK, 3EGK, 3JZ1, 3K65, 3PMH, 3QDZ, 4AX9, 4AYV, 4AYY, 4AZ2, 4CH2, 4CH8, 4HZH, 4I7Y, 4LOY, 4LXB, 4LZ1, 4LZ4, 4MLF, 4N3L, 4NZE, 4NZQ, 4O03, 4RKJ, 4RKO, 4RN6, 4YES, 4UD9, 4UDW, 4UE7, 4UEH, 5AF9, 5AFY, 5AFZ, 5AHG, 5CMX, 4UFD, 5EDM, 5E8E, 5EDK, 4UFE, 4UFG, 4UFF, 5A2M, 5JDU
Ідентифікатори
Символи	F2, PT, RPRGL2, THPH1, coagulation factor II, thrombin
Зовнішні ІД	OMIM: 176930 MGI: 88380 HomoloGene: 426 GeneCards: F2
Пов'язані генетичні захворювання
	hypoprothrombinemia, thrombophilia
Реагує на сполуку
	Дабігатран, ximelagatran, dabigatran etexilate, argatroban
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • signaling receptor binding; • GO:0070122 peptidase activity; • hydrolase activity; • growth factor activity; • serine-type peptidase activity; • thrombospondin receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • serine-type endopeptidase activity; • lipopolysaccharide binding; • heparin binding; • GO:0010577 enzyme activator activity;
Клітинна компонента	• екзосома; • blood microparticle; • endoplasmic reticulum lumen; • Golgi lumen; • клітинна мембрана; • extracellular region; • міжклітинний простір; • external side of plasma membrane; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• blood coagulation, intrinsic pathway; • regulation of blood coagulation; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • positive regulation of collagen biosynthetic process; • multicellular organism development; • peptidyl-glutamic acid carboxylation; • acute-phase response; • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • positive regulation of cell growth; • cell surface receptor signaling pathway; • регуляція експресії генів; • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; • positive regulation of cell population proliferation; • leukocyte migration; • negative regulation of fibrinolysis; • positive regulation of blood coagulation; • regulation of cytosolic calcium ion concentration; • response to wounding; • signal peptide processing; • positive regulation of phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; • regulation of cell shape; • гемостаз; • negative regulation of proteolysis; • negative regulation of platelet activation; • negative regulation of astrocyte differentiation; • positive regulation of protein phosphorylation; • фібриноліз; • зсідання крові; • протеоліз; • platelet activation; • positive regulation of protein localization to nucleus; • positive regulation of lipid kinase activity; • regulation of complement activation; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • regulation of signaling receptor activity; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT; • blood coagulation, fibrin clot formation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	2147
	14061
	ENSG00000180210
	ENSMUSG00000027249
	P00734
	P19221
	NM_000506; NM_001311257
	NM_010168
	NP_000497
	NP_034298
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Тромбін (активований фактор зсідання крові II, fibrinogenase, thrombase, thrombofort, topical, thrombin-C, tropostasin, activated blood-coagulation factor II, blood-coagulation factor IIa, factor IIa, E thrombin, beta-thrombin, gamma-thrombin) — білок, який кодується геном F2, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[5]^[6] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 622 амінокислот, а молекулярна маса — 70 037^[7]. Тромбін - важливий компонент системи згортання крові людини і тварин. Тромбін (КФ 3.4.21.5^[8]) відноситься до ферментів класу гідролаз, групи серинових протеаз, та каталізує гідроліз пептидних зв'язків, утворених залишками аргініну і лізину (має обмежену субстратну специфічність).

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAHVRGLQLP	GCLALAALCS	LVHSQHVFLA	PQQARSLLQR	VRRANTFLEE
VRKGNLEREC	VEETCSYEEA	FEALESSTAT	DVFWAKYTAC	ETARTPRDKL
AACLEGNCAE	GLGTNYRGHV	NITRSGIECQ	LWRSRYPHKP	EINSTTHPGA
DLQENFCRNP	DSSTTGPWCY	TTDPTVRRQE	CSIPVCGQDQ	VTVAMTPRSE
GSSVNLSPPL	EQCVPDRGQQ	YQGRLAVTTH	GLPCLAWASA	QAKALSKHQD
FNSAVQLVEN	FCRNPDGDEE	GVWCYVAGKP	GDFGYCDLNY	CEEAVEEETG
DGLDEDSDRA	IEGRTATSEY	QTFFNPRTFG	SGEADCGLRP	LFEKKSLEDK
TERELLESYI	DGRIVEGSDA	EIGMSPWQVM	LFRKSPQELL	CGASLISDRW
VLTAAHCLLY	PPWDKNFTEN	DLLVRIGKHS	RTRYERNIEK	ISMLEKIYIH
PRYNWRENLD	RDIALMKLKK	PVAFSDYIHP	VCLPDRETAA	SLLQAGYKGR
VTGWGNLKET	WTANVGKGQP	SVLQVVNLPI	VERPVCKDST	RIRITDNMFC
AGYKPDEGKR	GDACEGDSGG	PFVMKSPFNN	RWYQMGIVSW	GEGCDRDGKY
GFYTHVFRLK	KWIQKVIDQF	GE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як зсідання крові, гемостаз, гостра фаза запалення. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Секретований назовні.

Див. також

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з Тромбін переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з тромбін переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3535 (англ.) . Процитовано 5 жовтня 2018.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ Royle NJ, Irwin DM, Koschinsky ML, MacGillivray RT, Hamerton JL (May 1987). Human genes encoding prothrombin and ceruloplasmin map to 11p11-q12 and 3q21-24, respectively. Somat. Cell Mol. Genet. 13 (3): 285—92. doi:10.1007/BF01535211. PMID 3474786.
↑ UniProt, P00734 (англ.) . Процитовано 5 жовтня 2018.
↑ 3.4.21.5(англ.)

Література

Degen S.J.F., Davie E.W. (1987). Nucleotide sequence of the gene for human prothrombin. Biochemistry. 26: 6165—6177. PMID 2825773 DOI:10.1021/bi00393a033
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Degen S.J.F., McGillivray R.T.A., Davie E.W. (1983). Characterization of the complementary deoxyribonucleic acid and gene coding for human prothrombin. Biochemistry. 22: 2087—2097. PMID 6305407 DOI:10.1021/bi00278a008
Walz D.A., Hewett-Emmett D., Seegers W.H. (1977). Amino acid sequence of human prothrombin fragments 1 and 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74: 1969—1972. PMID 266717 DOI:10.1073/pnas.74.5.1969
Casas J.P., Hingorani A.D., Bautista L.E., Sharma P. (2004). Meta-analysis of genetic studies in ischemic stroke: thirty-two genes involving approximately 18,000 cases and 58,000 controls. Arch. Neurol. 61: 1652—1661. PMID 15534175 DOI:10.1001/archneur.61.11.1652
Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry. Proteomics. 4: 454—465. PMID 14760718 DOI:10.1002/pmic.200300556

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Тромбін переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з тромбін переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3535 (англ.) . Процитовано 5 жовтня 2018.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[pmid3474786-6] Royle NJ, Irwin DM, Koschinsky ML, MacGillivray RT, Hamerton JL (May 1987). Human genes encoding prothrombin and ceruloplasmin map to 11p11-q12 and 3q21-24, respectively. Somat. Cell Mol. Genet. 13 (3): 285—92. doi:10.1007/BF01535211. PMID 3474786.

[UniProt-7] UniProt, P00734 (англ.) . Процитовано 5 жовтня 2018.

[8] 3.4.21.5(англ.)

[5]

[6]

[7]

[8]

[1]

[2]

[3]

[4]