COL16A1
білок людини
COL16A1 (англ. Collagen type XVI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 604 амінокислот, а молекулярна маса — 157 751[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MWVSWAPGLW | LLGLWATFGH | GANTGAQCPP | SQQEGLKLEH | SSSLPANVTG | ||||
| FNLIHRLSLM | KTSAIKKIRN | PKGPLILRLG | AAPVTQPTRR | VFPRGLPEEF | ||||
| ALVLTLLLKK | HTHQKTWYLF | QVTDANGYPQ | ISLEVNSQER | SLELRAQGQD | ||||
| GDFVSCIFPV | PQLFDLRWHK | LMLSVAGRVA | SVHVDCSSAS | SQPLGPRRPM | ||||
| RPVGHVFLGL | DAEQGKPVSF | DLQQVHIYCD | PELVLEEGCC | EILPAGCPPE | ||||
| TSKARRDTQS | NELIEINPQS | EGKVYTRCFC | LEEPQNSEVD | AQLTGRISQK | ||||
| AERGAKVHQE | TAADECPPCV | HGARDSNVTL | APSGPKGGKG | ERGLPGPPGS | ||||
| KGEKGARGND | CVRISPDAPL | QCAEGPKGEK | GESGALGPSG | LPGSTGEKGQ | ||||
| KGEKGDGGIK | GVPGKPGRDG | RPGEICVIGP | KGQKGDPGFV | GPEGLAGEPG | ||||
| PPGLPGPPGI | GLPGTPGDPG | GPPGPKGDKG | SSGIPGKEGP | GGKPGKPGVK | ||||
| GEKGDPCEVC | PTLPEGFQNF | VGLPGKPGPK | GEPGDPVPAR | GDPGIQGIKG | ||||
| EKGEPCLSCS | SVVGAQHLVS | STGASGDVGS | PGFGLPGLPG | RAGVPGLKGE | ||||
| KGNFGEAGPA | GSPGPPGPVG | PAGIKGAKGE | PCEPCPALSN | LQDGDVRVVA | ||||
| LPGPSGEKGE | PGPPGFGLPG | KQGKAGERGL | KGQKGDAGNP | GDPGTPGTTG | ||||
| RPGLSGEPGV | QGPAGPKGEK | GDGCTACPSL | QGTVTDMAGR | PGQPGPKGEQ | ||||
| GPEGVGRPGK | PGQPGLPGVQ | GPPGLKGVQG | EPGPPGRGVQ | GPQGEPGAPG | ||||
| LPGIQGLPGP | RGPPGPTGEK | GAQGSPGVKG | ATGPVGPPGA | SVSGPPGRDG | ||||
| QQGQTGLRGT | PGEKGPRGEK | GEPGECSCPS | QGDLIFSGMP | GAPGLWMGSS | ||||
| WQPGPQGPPG | IPGPPGPPGV | PGLQGVPGNN | GLPGQPGLTA | ELGSLPIEQH | ||||
| LLKSICGDCV | QGQRAHPGYL | VEKGEKGDQG | IPGVPGLDNC | AQCFLSLERP | ||||
| RAEEARGDNS | EGDPGCVGSP | GLPGPPGLPG | QRGEEGPPGM | RGSPGPPGPI | ||||
| GPPGFPGAVG | SPGLPGLQGE | RGLTGLTGDK | GEPGPPGQPG | YPGATGPPGL | ||||
| PGIKGERGYT | GSAGEKGEPG | PPGSEGLPGP | PGPAGPRGER | GPQGNSGEKG | ||||
| DQGFQGQPGF | PGPPGPPGFP | GKVGSPGPPG | PQAEKGSEGI | RGPSGLPGSP | ||||
| GPPGPPGIQG | PAGLDGLDGK | DGKPGLRGDP | GPAGPPGLMG | PPGFKGKTGH | ||||
| PGLPGPKGDC | GKPGPPGSTG | RPGAEGEPGA | MGPQGRPGPP | GHVGPPGPPG | ||||
| QPGPAGISAV | GLKGDRGATG | ERGLAGLPGQ | PGPPGHPGPP | GEPGTDGAAG | ||||
| KEGPPGKQGF | YGPPGPKGDP | GAAGQKGQAG | EKGRAGMPGG | PGKSGSMGPV | ||||
| GPPGPAGERG | HPGAPGPSGS | PGLPGVPGSM | GDMVNYDEIK | RFIRQEIIKM | ||||
| FDERMAYYTS | RMQFPMEMAA | APGRPGPPGK | DGAPGRPGAP | GSPGLPGQIG | ||||
| REGRQGLPGV | RGLPGTKGEK | GDIGIGIAGE | NGLPGPPGPQ | GPPGYGKMGA | ||||
| TGPMGQQGIP | GIPGPPGPMG | QPGKAGHCNP | SDCFGAMPME | QQYPPMKTMK | ||||
| GPFG |
Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
ред.- Pan T.-C., Zhang R.-Z., Mattei M.-G., Timpl R., Chu M.-L. (1992). Cloning and chromosomal location of human alpha 1(XVI) collagen. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 6565—6569. PMID 1631157 DOI:10.1073/pnas.89.14.6565
- Grassel S., Timpl R., Tan E.M.L., Chu M.-L. (1996). Biosynthesis and processing of type XVI collagen in human fibroblasts and smooth muscle cells. Eur. J. Biochem. 242: 576—584. PMID 9022684 DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.0576r.x
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2193 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]
- ↑ UniProt, Q07092 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
ред.
|
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |