IDH1

IDH1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1T09, 1T0L, 3INM, 3MAP, 3MAR, 3MAS, 4I3K, 4I3L, 4KZO, 4L03, 4L04, 4L06, 4UMX, 4UMY, 4XRX, 5DE1, 4XS3, 5K10, 5K11
Ідентифікатори
Символи	IDH1, HEL-216, HEL-S-26, IDCD, IDH, IDP, IDPC, PICD, isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 1, cytosolic, isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 1
Зовнішні ІД	OMIM: 147700 MGI: 96413 HomoloGene: 21195 GeneCards: IDH1
Пов'язані генетичні захворювання
	гострий мієлоїдний лейкоз, гліобластома
Онтологія гена
Молекулярна функція	• magnesium ion binding; • protein homodimerization activity; • GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor; • signaling receptor binding; • isocitrate dehydrogenase (NADP+) activity; • oxidoreductase activity; • NAD binding; • isocitrate dehydrogenase activity; • NADP binding; • зв'язування з іоном металу; • (R)-2-hydroxyglutarate dehydrogenase activity; • cadherin binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• пероксисома; • гіалоплазма; • екзосома; • peroxisomal matrix; • цитоплазма; • мітохондрія; • extracellular region; • secretory granule lumen; • tertiary granule lumen; • ficolin-1-rich granule lumen;
Біологічний процес	• female gonad development; • NADPH regeneration; • GO:0001306 response to oxidative stress; • GO:1904578 response to organic cyclic compound; • response to steroid hormone; • 2-oxoglutarate metabolic process; • regulation of phospholipid catabolic process; • isocitrate metabolic process; • glyoxylate cycle; • цикл трикарбонових кислот; • regulation of phospholipid biosynthetic process; • glutathione metabolic process; • neutrophil degranulation; • protein _targeting to peroxisome; • NADP metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3417
	15926
	ENSG00000138413
	ENSMUSG00000025950
	O75874
	O88844
	NM_005896; NM_001282386; NM_001282387
	NM_001111320; NM_010497
	NP_001269315; NP_001269316; NP_005887
	NP_001104790; NP_034627
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IDH1 (англ. Isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 1, cytosolic) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот, а молекулярна маса — 46 659^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSKKISGGSV	VEMQGDEMTR	IIWELIKEKL	IFPYVELDLH	SYDLGIENRD
ATNDQVTKDA	AEAIKKHNVG	VKCATITPDE	KRVEEFKLKQ	MWKSPNGTIR
NILGGTVFRE	AIICKNIPRL	VSGWVKPIII	GRHAYGDQYR	ATDFVVPGPG
KVEITYTPSD	GTQKVTYLVH	NFEEGGGVAM	GMYNQDKSIE	DFAHSSFQMA
LSKGWPLYLS	TKNTILKKYD	GRFKDIFQEI	YDKQYKSQFE	AQKIWYEHRL
IDDMVAQAMK	SEGGFIWACK	NYDGDVQSDS	VAQGYGSLGM	MTSVLVCPDG
KTVEAEAAHG	TVTRHYRMYQ	KGQETSTNPI	ASIFAWTRGL	AHRAKLDNNK
ELAFFANALE	EVSIETIEAG	FMTKDLAACI	KGLPNVQRSD	YLNTFEFMDK
LGENLKIKLA	QAKL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як цикл трикарбонових кислот, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, НАДФ, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, пероксисомах.

Література

Nekrutenko A., Hillis D.M., Patton J.C., Bradley R.D., Baker R.J. (1998). Cytosolic isocitrate dehydrogenase in humans, mice, and voles and phylogenetic analysis of the enzyme family. Mol. Biol. Evol. 15: 1674—1684. PMID 9866202 DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a025894
Geisbrecht B.V., Gould S.J. (1999). The human PICD gene encodes a cytoplasmic and peroxisomal NADP(+)-dependent isocitrate dehydrogenase. J. Biol. Chem. 274: 30527—30533. PMID 10521434 DOI:10.1074/jbc.274.43.30527
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504