PAPOLA

PAPOLA (англ. Poly(A) polymerase alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 745 амінокислот, а молекулярна маса — 82 843.

PAPOLA
Ідентифікатори
Символи	PAPOLA, PAP, poly(A) polymerase alpha, PAP-alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 605553 MGI: 109301 HomoloGene: 23389 GeneCards: PAPOLA
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • nucleotidyltransferase activity • manganese ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • ATP binding • magnesium ion binding • polynucleotide adenylyltransferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • RNA 3'-end processing • mRNA processing • mRNA polyadenylation • mRNA 3'-end processing • regulation of mRNA 3'-end processing • RNA polyadenylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10914	18789
Ensembl	ENSG00000090060	ENSMUSG00000021111
UniProt	P51003	Q61183
RefSeq (мРНК)	NM_001252006 NM_001252007 NM_001293627 NM_001293628 NM_001293632 NM_032632 NM_001363662 NM_001363664 NM_001363665 NM_001363666	NM_011112 NM_001347440
RefSeq (білок)	NP_001238935 NP_001238936 NP_001280556 NP_001280557 NP_001280561 NP_116021 NP_001350591 NP_001350593 NP_001350594 NP_001350595	NP_001334369 NP_035242
Локус (UCSC)	Хр. 14: 96.5 – 96.57 Mb	Хр. 12: 105.75 – 105.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPFPVTTQGS		QQTQPPQKHY		GITSPISLAA		PKETDCVLTQ		KLIETLKPFG
VFEEEEELQR		RILILGKLNN		LVKEWIREIS		ESKNLPQSVI		ENVGGKIFTF
GSYRLGVHTK		GADIDALCVA		PRHVDRSDFF		TSFYDKLKLQ		EEVKDLRAVE
EAFVPVIKLC		FDGIEIDILF		ARLALQTIPE		DLDLRDDSLL		KNLDIRCIRS
LNGCRVTDEI		LHLVPNIDNF		RLTLRAIKLW		AKRHNIYSNI		LGFLGGVSWA
MLVARTCQLY		PNAIASTLVH		KFFLVFSKWE		WPNPVLLKQP		EECNLNLPVW
DPRVNPSDRY		HLMPIITPAY		PQQNSTYNVS		VSTRMVMVEE		FKQGLAITDE
ILLSKAEWSK		LFEAPNFFQK		YKHYIVLLAS		APTEKQRLEW		VGLVESKIRI
LVGSLEKNEF		ITLAHVNPQS		FPAPKENPDK		EEFRTMWVIG		LVFKKTENSE
NLSVDLTYDI		QSFTDTVYRQ		AINSKMFEVD		MKIAAMHVKR		KQLHQLLPNH
VLQKKKKHST		EGVKLTALND		SSLDLSMDSD		NSMSVPSPTS		ATKTSPLNSS
GSSQGRNSPA		PAVTAASVTN		IQATEVSVPQ		VNSSESSGGT		SSESIPQTAT
QPAISPPPKP		TVSRVVSSTR		LVNPPPRSSG		NAATSGNAAT		KIPTPIVGVK
RTSSPHKEES		PKKTKTEEDE		TSEDANCLAL		SGHDKTEAKE		QLDTETSTTQ
SETIQTAASL		LASQKTSSTD		LSDIPALPAN		PIPVIKNSIK		LRLNR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію, РНК, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Thuresson A.-C., Aastroem J., Aastroem A., Groenvik K.-O., Virtanen A. (1994). Multiple forms of poly(A) polymerases in human cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 979—983. PMID 8302877 DOI:10.1073/pnas.91.3.979
• Dettwiler S., Aringhieri C., Cardinale S., Keller W., Barabino S.M. (2004). Distinct sequence motifs within the 68-kDa subunit of cleavage factor Im mediate RNA binding, protein-protein interactions, and subcellular localization. J. Biol. Chem. 279: 35788—35797. PMID 15169763 DOI:10.1074/jbc.M403927200
• Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070

Див. також

• Хромосома 14