TNFSF10

TNFSF10 (англ. TNF superfamily member 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 281 амінокислот, а молекулярна маса — 32 509.

TNFSF10
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1D0G, 1D2Q, 1D4V, 1DG6, 1DU3, 4N90
Ідентифікатори
Символи	TNFSF10, APO2L, Apo-2L, CD253, TL2, TRAIL, TNLG6A, tumor necrosis factor superfamily member 10, TNF superfamily member 10
Зовнішні ІД	OMIM: 603598 MGI: 107414 HomoloGene: 2824 GeneCards: TNFSF10
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor receptor superfamily binding • tumor necrosis factor receptor binding • signaling receptor binding • zinc ion binding • identical protein binding • TRAIL binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір • клітинна мембрана Біологічний процес • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway • cell-cell signaling • cell surface receptor signaling pathway • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • positive regulation of apoptotic process • male gonad development • response to insulin • regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8743	22035
Ensembl	ENSG00000121858	ENSMUSG00000039304
UniProt	P50591	P50592
RefSeq (мРНК)	NM_001190942 NM_001190943 NM_003810	NM_009425
RefSeq (білок)	NP_001177871 NP_001177872 NP_003801	NP_033451
Локус (UCSC)	Хр. 3: 172.51 – 172.52 Mb	Хр. 3: 27.37 – 27.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAMMEVQGGP		SLGQTCVLIV		IFTVLLQSLC		VAVTYVYFTN		ELKQMQDKYS
KSGIACFLKE		DDSYWDPNDE		ESMNSPCWQV		KWQLRQLVRK		MILRTSEETI
STVQEKQQNI		SPLVRERGPQ		RVAAHITGTR		GRSNTLSSPN		SKNEKALGRK
INSWESSRSG		HSFLSNLHLR		NGELVIHEKG		FYYIYSQTYF		RFQEEIKENT
KNDKQMVQYI		YKYTSYPDPI		LLMKSARNSC		WSKDAEYGLY		SIYQGGIFEL
KENDRIFVSV		TNEHLIDMDH		EASFFGAFLV		G

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3