WRN

WRN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2AXL, 2DGZ, 2E1E, 2E1F, 2FBT, 2FBV, 2FBX, 2FBY, 2FC0, 3AAF
Ідентифікатори
Символи	WRN, RECQ3, RECQL2, RECQL3, Werner syndrome RecQ like helicase, WRN RecQ like helicase
Зовнішні ІД	OMIM: 604611 MGI: 109635 HomoloGene: 6659 GeneCards: WRN
шифр КФ	3.1.-.-
Пов'язані генетичні захворювання
	Werner syndrome, колоректальний рак
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • nucleotide binding; • manganese ion binding; • protein homodimerization activity; • GO:0008026 helicase activity; • GO:0004003 DNA helicase activity; • bubble DNA binding; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • G-quadruplex DNA binding; • ATPase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • каталітична активність; • 3'-5' exonuclease activity; • Y-form DNA binding; • nucleic acid binding; • nuclease activity; • GO:0043140 3'-5' DNA helicase activity; • GO:1990163 four-way junction helicase activity; • ATP binding; • magnesium ion binding; • hydrolase activity; • exonuclease activity; • telomeric D-loop binding; • 3'-flap-structured DNA binding; • four-way junction DNA binding; • forked DNA-dependent helicase activity; • telomeric G-quadruplex DNA binding; • 8-hydroxy-2'-deoxyguanosine DNA binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • MutLalpha complex binding;
Клітинна компонента	• центросома; • внутрішньоклітинний; • нуклеоплазма; • ядерце; • neuron projection; • MutLalpha complex; • клітинне ядро; • цитоплазма; • nuclear speck; • теломера; • replication fork; • DNA replication factor A complex; • хромосома; • site of double-strand break;
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process; • positive regulation of hydrolase activity; • DNA recombination; • cellular response to starvation; • DNA metabolic process; • GO:0010260 старіння людини; • GO:0001306 response to oxidative stress; • cellular response to DNA damage stimulus; • regulation of growth rate; • brain development; • cell metabolism; • cellular response to gamma radiation; • replication fork processing; • multicellular organism aging; • обмін речовин; • nucleobase-containing compound metabolic process; • response to UV-C; • base-excision repair; • double-strand break repair; • GO:0100026 Репарація ДНК; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • double-strand break repair via homologous recombination; • DNA duplex unwinding; • реплікація ДНК; • telomeric D-loop disassembly; • t-circle formation; • positive regulation of strand invasion; • telomere maintenance; • G-quadruplex DNA unwinding; • protein localization to nucleolus; • DNA synthesis involved in DNA repair; • determination of adult lifespan; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • DNA unwinding involved in DNA replication;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7486
	22427
	ENSG00000165392
	ENSMUSG00000031583
	Q14191
	O09053
	NM_000553
	NM_001122822; NM_011721
	NP_000544
	NP_001116294; NP_035851
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

WRN (англ. Werner syndrome RecQ like helicase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 432 амінокислот, а молекулярна маса — 162 461^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSEKKLETTA	QQRKCPEWMN	VQNKRCAVEE	RKACVRKSVF	EDDLPFLEFT
GSIVYSYDAS	DCSFLSEDIS	MSLSDGDVVG	FDMEWPPLYN	RGKLGKVALI
QLCVSESKCY	LFHVSSMSVF	PQGLKMLLEN	KAVKKAGVGI	EGDQWKLLRD
FDIKLKNFVE	LTDVANKKLK	CTETWSLNSL	VKHLLGKQLL	KDKSIRCSNW
SKFPLTEDQK	LYAATDAYAG	FIIYRNLEIL	DDTVQRFAIN	KEEEILLSDM
NKQLTSISEE	VMDLAKHLPH	AFSKLENPRR	VSILLKDISE	NLYSLRRMII
GSTNIETELR	PSNNLNLLSF	EDSTTGGVQQ	KQIREHEVLI	HVEDETWDPT
LDHLAKHDGE	DVLGNKVERK	EDGFEDGVED	NKLKENMERA	CLMSLDITEH
ELQILEQQSQ	EEYLSDIAYK	STEHLSPNDN	ENDTSYVIES	DEDLEMEMLK
HLSPNDNEND	TSYVIESDED	LEMEMLKSLE	NLNSGTVEPT	HSKCLKMERN
LGLPTKEEEE	DDENEANEGE	EDDDKDFLWP	APNEEQVTCL	KMYFGHSSFK
PVQWKVIHSV	LEERRDNVAV	MATGYGKSLC	FQYPPVYVGK	IGLVISPLIS
LMEDQVLQLK	MSNIPACFLG	SAQSENVLTD	IKLGKYRIVY	VTPEYCSGNM
GLLQQLEADI	GITLIAVDEA	HCISEWGHDF	RDSFRKLGSL	KTALPMVPIV
ALTATASSSI	REDIVRCLNL	RNPQITCTGF	DRPNLYLEVR	RKTGNILQDL
QPFLVKTSSH	WEFEGPTIIY	CPSRKMTQQV	TGELRKLNLS	CGTYHAGMSF
STRKDIHHRF	VRDEIQCVIA	TIAFGMGINK	ADIRQVIHYG	APKDMESYYQ
EIGRAGRDGL	QSSCHVLWAP	ADINLNRHLL	TEIRNEKFRL	YKLKMMAKME
KYLHSSRCRR	QIILSHFEDK	QVQKASLGIM	GTEKCCDNCR	SRLDHCYSMD
DSEDTSWDFG	PQAFKLLSAV	DILGEKFGIG	LPILFLRGSN	SQRLADQYRR
HSLFGTGKDQ	TESWWKAFSR	QLITEGFLVE	VSRYNKFMKI	CALTKKGRNW
LHKANTESQS	LILQANEELC	PKKLLLPSSK	TVSSGTKEHC	YNQVPVELST
EKKSNLEKLY	SYKPCDKISS	GSNISKKSIM	VQSPEKAYSS	SQPVISAQEQ
ETQIVLYGKL	VEARQKHANK	MDVPPAILAT	NKILVDMAKM	RPTTVENVKR
IDGVSEGKAA	MLAPLLEVIK	HFCQTNSVQT	DLFSSTKPQE	EQKTSLVAKN
KICTLSQSMA	ITYSLFQEKK	MPLKSIAESR	ILPLMTIGMH	LSQAVKAGCP
LDLERAGLTP	EVQKIIADVI	RNPPVNSDMS	KISLIRMLVP	ENIDTYLIHM
AIEILKHGPD	SGLQPSCDVN	KRRCFPGSEE	ICSSSKRSKE	EVGINTETSS
AERKRRLPVW	FAKGSDTSKK	LMDKTKRGGL	FS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

Marciniak R.A., Lombard D.B., Johnson F.B., Guarente L. (1998). Nucleolar localization of the Werner syndrome protein in human cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 6887—6892. PMID 9618508 DOI:10.1073/pnas.95.12.6887
Kamath-Loeb A.S., Lan L., Nakajima S., Yasui A., Loeb L.A. (2007). Werner syndrome protein interacts functionally with translesion DNA polymerases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 10394—10399. PMID 17563354 DOI:10.1073/pnas.0702513104
Compton S.A., Tolun G., Kamath-Loeb A.S., Loeb L.A., Griffith J.D. (2008). The Werner syndrome protein binds replication fork and Holliday junction DNAs as an oligomer. J. Biol. Chem. 283: 24478—24483. PMID 18596042 DOI:10.1074/jbc.M803370200
Opresko P.L., Sowd G., Wang H. (2009). The Werner syndrome helicase/exonuclease processes mobile D-loops through branch migration and degradation. PLoS ONE. 4: E4825—E4825. PMID 19283071 DOI:10.1371/journal.pone.0004825
Lee H., Flaherty P., Ji H.P. (2013). Systematic genomic identification of colorectal cancer genes delineating advanced from early clinical stage and metastasis. BMC Med. Genomics. 6: 54—54. PMID 24308539 DOI:10.1186/1755-8794-6-54
Hu J.S., Feng H., Zeng W., Lin G.X., Xi X.G. (2005). Solution structure of a multifunctional DNA- and protein-binding motif of human Werner syndrome protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 18379—18384. PMID 16339893 DOI:10.1073/pnas.0509380102